Protein–RNA interactions for Protein: P28230

Gjb1, Gap junction beta-1 protein, mousemouse

Predictions only

Length 283 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gjb1P28230 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Gjb1P28230 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
Gjb1P28230 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Gjb1P28230 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Gjb1P28230 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Gjb1P28230 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Gjb1P28230 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Gjb1P28230 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Gjb1P28230 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
Gjb1P28230 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Gjb1P28230 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Gjb1P28230 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
Gjb1P28230 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Gjb1P28230 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Gjb1P28230 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Gjb1P28230 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
Gjb1P28230 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Gjb1P28230 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Gjb1P28230 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Gjb1P28230 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Gjb1P28230 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
Gjb1P28230 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Gjb1P28230 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Gjb1P28230 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Gjb1P28230 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Gjb1P28230 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Gjb1P28230 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Gjb1P28230 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Gjb1P28230 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Gjb1P28230 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
Gjb1P28230 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Gjb1P28230 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Gjb1P28230 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Gjb1P28230 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Gjb1P28230 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Gjb1P28230 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Gjb1P28230 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Gjb1P28230 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Gjb1P28230 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Gjb1P28230 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Gjb1P28230 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Gjb1P28230 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
Gjb1P28230 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Gjb1P28230 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Gjb1P28230 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Gjb1P28230 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
Gjb1P28230 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
Gjb1P28230 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Gjb1P28230 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Gjb1P28230 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Gjb1P28230 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Gjb1P28230 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Gjb1P28230 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Gjb1P28230 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Gjb1P28230 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Gjb1P28230 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Gjb1P28230 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Gjb1P28230 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Gjb1P28230 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Gjb1P28230 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Gjb1P28230 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Gjb1P28230 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Gjb1P28230 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Gjb1P28230 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Gjb1P28230 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Gjb1P28230 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Gjb1P28230 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Gjb1P28230 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Gjb1P28230 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Gjb1P28230 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Gjb1P28230 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Gjb1P28230 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Gjb1P28230 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Gjb1P28230 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Gjb1P28230 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Gjb1P28230 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Gjb1P28230 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Gjb1P28230 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
Gjb1P28230 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Gjb1P28230 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Gjb1P28230 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Gjb1P28230 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Gjb1P28230 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Gjb1P28230 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Gjb1P28230 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Gjb1P28230 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Gjb1P28230 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Gjb1P28230 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Gjb1P28230 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Gjb1P28230 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Gjb1P28230 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Gjb1P28230 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Gjb1P28230 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Gjb1P28230 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Gjb1P28230 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Gjb1P28230 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Gjb1P28230 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Gjb1P28230 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Gjb1P28230 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Gjb1P28230 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.3 ms