Protein–RNA interactions for Protein: P23819

Gria2, Glutamate receptor 2, mousemouse

Predictions only

Length 883 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gria2P23819 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Gria2P23819 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
Gria2P23819 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Gria2P23819 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Gria2P23819 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Gria2P23819 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Gria2P23819 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Gria2P23819 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Gria2P23819 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Gria2P23819 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Gria2P23819 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Gria2P23819 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Gria2P23819 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Gria2P23819 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Gria2P23819 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Gria2P23819 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
Gria2P23819 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Gria2P23819 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Gria2P23819 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Gria2P23819 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Gria2P23819 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Gria2P23819 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Gria2P23819 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Gria2P23819 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Gria2P23819 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Gria2P23819 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Gria2P23819 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Gria2P23819 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Gria2P23819 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Gria2P23819 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Gria2P23819 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Gria2P23819 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Gria2P23819 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Gria2P23819 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Gria2P23819 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Gria2P23819 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Gria2P23819 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Gria2P23819 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Gria2P23819 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Gria2P23819 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Gria2P23819 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Gria2P23819 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Gria2P23819 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Gria2P23819 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Gria2P23819 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Gria2P23819 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Gria2P23819 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Gria2P23819 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
Gria2P23819 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Gria2P23819 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Gria2P23819 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Gria2P23819 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Gria2P23819 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Gria2P23819 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Gria2P23819 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Gria2P23819 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Gria2P23819 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Gria2P23819 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
Gria2P23819 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Gria2P23819 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Gria2P23819 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Gria2P23819 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Gria2P23819 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Gria2P23819 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Gria2P23819 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Gria2P23819 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Gria2P23819 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Gria2P23819 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Gria2P23819 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
Gria2P23819 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
Gria2P23819 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Gria2P23819 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
Gria2P23819 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Gria2P23819 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Gria2P23819 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Gria2P23819 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Gria2P23819 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Gria2P23819 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Gria2P23819 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Gria2P23819 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Gria2P23819 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Gria2P23819 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Gria2P23819 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Gria2P23819 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Gria2P23819 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Gria2P23819 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Gria2P23819 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Gria2P23819 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Gria2P23819 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Gria2P23819 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Gria2P23819 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Gria2P23819 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Gria2P23819 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
Gria2P23819 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Gria2P23819 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Gria2P23819 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Gria2P23819 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Gria2P23819 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Gria2P23819 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Gria2P23819 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 77.3 ms