Protein–RNA interactions for Protein: P20181

Ntf3, Neurotrophin-3, mousemouse

Predictions only

Length 258 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ntf3P20181 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ntf3P20181 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ntf3P20181 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ntf3P20181 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ntf3P20181 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ntf3P20181 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ntf3P20181 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ntf3P20181 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ntf3P20181 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ntf3P20181 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ntf3P20181 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ntf3P20181 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ntf3P20181 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ntf3P20181 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ntf3P20181 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ntf3P20181 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ntf3P20181 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ntf3P20181 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Ntf3P20181 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ntf3P20181 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Ntf3P20181 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ntf3P20181 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ntf3P20181 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ntf3P20181 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ntf3P20181 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ntf3P20181 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ntf3P20181 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ntf3P20181 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ntf3P20181 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ntf3P20181 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ntf3P20181 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ntf3P20181 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ntf3P20181 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ntf3P20181 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ntf3P20181 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ntf3P20181 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ntf3P20181 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ntf3P20181 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ntf3P20181 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Ntf3P20181 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ntf3P20181 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ntf3P20181 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ntf3P20181 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ntf3P20181 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ntf3P20181 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ntf3P20181 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ntf3P20181 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ntf3P20181 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ntf3P20181 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ntf3P20181 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ntf3P20181 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ntf3P20181 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ntf3P20181 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ntf3P20181 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ntf3P20181 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ntf3P20181 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ntf3P20181 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ntf3P20181 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ntf3P20181 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ntf3P20181 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ntf3P20181 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ntf3P20181 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ntf3P20181 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ntf3P20181 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Ntf3P20181 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Ntf3P20181 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
Ntf3P20181 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ntf3P20181 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ntf3P20181 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ntf3P20181 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ntf3P20181 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ntf3P20181 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ntf3P20181 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ntf3P20181 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ntf3P20181 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ntf3P20181 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ntf3P20181 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ntf3P20181 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ntf3P20181 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ntf3P20181 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ntf3P20181 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ntf3P20181 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ntf3P20181 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ntf3P20181 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ntf3P20181 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ntf3P20181 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ntf3P20181 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ntf3P20181 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ntf3P20181 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ntf3P20181 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ntf3P20181 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ntf3P20181 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ntf3P20181 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ntf3P20181 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ntf3P20181 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ntf3P20181 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ntf3P20181 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ntf3P20181 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ntf3P20181 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ntf3P20181 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59 ms