Protein–RNA interactions for Protein: P20152

Vim, Vimentin, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 466 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VimP20152 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
VimP20152 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
VimP20152 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
VimP20152 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
VimP20152 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
VimP20152 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
VimP20152 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
VimP20152 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
VimP20152 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
VimP20152 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
VimP20152 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
VimP20152 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
VimP20152 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
VimP20152 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
VimP20152 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
VimP20152 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
VimP20152 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
VimP20152 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
VimP20152 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
VimP20152 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
VimP20152 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
VimP20152 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
VimP20152 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
VimP20152 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
VimP20152 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
VimP20152 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
VimP20152 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
VimP20152 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
VimP20152 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
VimP20152 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
VimP20152 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
VimP20152 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
VimP20152 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
VimP20152 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
VimP20152 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
VimP20152 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
VimP20152 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
VimP20152 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
VimP20152 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC20.27■□□□□ 0.84
VimP20152 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
VimP20152 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
VimP20152 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
VimP20152 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
VimP20152 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
VimP20152 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
VimP20152 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
VimP20152 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
VimP20152 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
VimP20152 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.83
VimP20152 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
VimP20152 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
VimP20152 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
VimP20152 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
VimP20152 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
VimP20152 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC20.25■□□□□ 0.83
VimP20152 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
VimP20152 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
VimP20152 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
VimP20152 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
VimP20152 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
VimP20152 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
VimP20152 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
VimP20152 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
VimP20152 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
VimP20152 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
VimP20152 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
VimP20152 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
VimP20152 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
VimP20152 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
VimP20152 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
VimP20152 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
VimP20152 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
VimP20152 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
VimP20152 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
VimP20152 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC20.23■□□□□ 0.83
VimP20152 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
VimP20152 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
VimP20152 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
VimP20152 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
VimP20152 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
VimP20152 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
VimP20152 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
VimP20152 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
VimP20152 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
VimP20152 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
VimP20152 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
VimP20152 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
VimP20152 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
VimP20152 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
VimP20152 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
VimP20152 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
VimP20152 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
VimP20152 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
VimP20152 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
VimP20152 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
VimP20152 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
VimP20152 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
VimP20152 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
VimP20152 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
VimP20152 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41 ms