Protein–RNA interactions for Protein: P13373

Vpreb2, Immunoglobulin omega chain, mousemouse

Predictions only

Length 142 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vpreb2P13373 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Vpreb2P13373 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Vpreb2P13373 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Vpreb2P13373 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Vpreb2P13373 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Vpreb2P13373 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Vpreb2P13373 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Vpreb2P13373 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Vpreb2P13373 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Vpreb2P13373 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Vpreb2P13373 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Vpreb2P13373 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Vpreb2P13373 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Vpreb2P13373 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Vpreb2P13373 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Vpreb2P13373 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Vpreb2P13373 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Vpreb2P13373 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Vpreb2P13373 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Vpreb2P13373 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Vpreb2P13373 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Vpreb2P13373 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Vpreb2P13373 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Vpreb2P13373 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Vpreb2P13373 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Vpreb2P13373 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Vpreb2P13373 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Vpreb2P13373 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Vpreb2P13373 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Vpreb2P13373 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Vpreb2P13373 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Vpreb2P13373 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Vpreb2P13373 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Vpreb2P13373 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Vpreb2P13373 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Vpreb2P13373 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Vpreb2P13373 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Vpreb2P13373 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Vpreb2P13373 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Vpreb2P13373 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Vpreb2P13373 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Vpreb2P13373 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Vpreb2P13373 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Vpreb2P13373 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Vpreb2P13373 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Vpreb2P13373 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Vpreb2P13373 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Vpreb2P13373 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Vpreb2P13373 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Vpreb2P13373 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Vpreb2P13373 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Vpreb2P13373 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Vpreb2P13373 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Vpreb2P13373 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Vpreb2P13373 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Vpreb2P13373 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Vpreb2P13373 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Vpreb2P13373 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Vpreb2P13373 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Vpreb2P13373 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Vpreb2P13373 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Vpreb2P13373 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Vpreb2P13373 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Vpreb2P13373 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Vpreb2P13373 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Vpreb2P13373 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Vpreb2P13373 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Vpreb2P13373 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Vpreb2P13373 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Vpreb2P13373 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Vpreb2P13373 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Vpreb2P13373 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Vpreb2P13373 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Vpreb2P13373 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Vpreb2P13373 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Vpreb2P13373 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Vpreb2P13373 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Vpreb2P13373 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Vpreb2P13373 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Vpreb2P13373 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Vpreb2P13373 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Vpreb2P13373 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Vpreb2P13373 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Vpreb2P13373 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.31
Vpreb2P13373 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Vpreb2P13373 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Vpreb2P13373 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Vpreb2P13373 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Vpreb2P13373 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Vpreb2P13373 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Vpreb2P13373 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Vpreb2P13373 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Vpreb2P13373 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Vpreb2P13373 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Vpreb2P13373 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Vpreb2P13373 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Vpreb2P13373 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Vpreb2P13373 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Vpreb2P13373 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Vpreb2P13373 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.3 ms