Protein–RNA interactions for Protein: P09084

Pax1, Paired box protein Pax-1, mousemouse

Predictions only

Length 446 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pax1P09084 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pax1P09084 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pax1P09084 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pax1P09084 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pax1P09084 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pax1P09084 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pax1P09084 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pax1P09084 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Pax1P09084 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pax1P09084 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pax1P09084 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pax1P09084 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pax1P09084 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pax1P09084 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pax1P09084 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pax1P09084 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pax1P09084 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pax1P09084 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pax1P09084 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pax1P09084 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pax1P09084 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pax1P09084 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pax1P09084 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pax1P09084 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pax1P09084 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pax1P09084 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pax1P09084 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pax1P09084 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pax1P09084 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pax1P09084 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pax1P09084 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pax1P09084 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pax1P09084 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pax1P09084 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pax1P09084 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pax1P09084 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pax1P09084 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pax1P09084 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pax1P09084 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pax1P09084 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pax1P09084 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pax1P09084 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pax1P09084 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pax1P09084 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pax1P09084 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pax1P09084 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pax1P09084 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pax1P09084 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pax1P09084 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pax1P09084 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Pax1P09084 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pax1P09084 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pax1P09084 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pax1P09084 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pax1P09084 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pax1P09084 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pax1P09084 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pax1P09084 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pax1P09084 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pax1P09084 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pax1P09084 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pax1P09084 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pax1P09084 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pax1P09084 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pax1P09084 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pax1P09084 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pax1P09084 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pax1P09084 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pax1P09084 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pax1P09084 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pax1P09084 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pax1P09084 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pax1P09084 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pax1P09084 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pax1P09084 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pax1P09084 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pax1P09084 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pax1P09084 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pax1P09084 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pax1P09084 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pax1P09084 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pax1P09084 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pax1P09084 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pax1P09084 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pax1P09084 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pax1P09084 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pax1P09084 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pax1P09084 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pax1P09084 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pax1P09084 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pax1P09084 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pax1P09084 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pax1P09084 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pax1P09084 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pax1P09084 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pax1P09084 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pax1P09084 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pax1P09084 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pax1P09084 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pax1P09084 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.1 ms