Protein–RNA interactions for Protein: P07350

Ifna6, Interferon alpha-6, mousemouse

Predictions only

Length 189 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ifna6P07350 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ifna6P07350 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ifna6P07350 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ifna6P07350 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ifna6P07350 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ifna6P07350 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ifna6P07350 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ifna6P07350 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ifna6P07350 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ifna6P07350 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ifna6P07350 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ifna6P07350 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ifna6P07350 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ifna6P07350 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ifna6P07350 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ifna6P07350 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ifna6P07350 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ifna6P07350 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ifna6P07350 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ifna6P07350 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ifna6P07350 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ifna6P07350 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ifna6P07350 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ifna6P07350 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ifna6P07350 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ifna6P07350 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ifna6P07350 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ifna6P07350 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ifna6P07350 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ifna6P07350 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ifna6P07350 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ifna6P07350 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ifna6P07350 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ifna6P07350 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ifna6P07350 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ifna6P07350 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ifna6P07350 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Ifna6P07350 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ifna6P07350 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ifna6P07350 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ifna6P07350 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ifna6P07350 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ifna6P07350 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ifna6P07350 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ifna6P07350 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ifna6P07350 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ifna6P07350 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ifna6P07350 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ifna6P07350 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ifna6P07350 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ifna6P07350 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ifna6P07350 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ifna6P07350 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ifna6P07350 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ifna6P07350 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ifna6P07350 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ifna6P07350 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ifna6P07350 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ifna6P07350 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ifna6P07350 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ifna6P07350 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ifna6P07350 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ifna6P07350 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ifna6P07350 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ifna6P07350 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ifna6P07350 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ifna6P07350 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ifna6P07350 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ifna6P07350 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ifna6P07350 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ifna6P07350 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ifna6P07350 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ifna6P07350 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ifna6P07350 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ifna6P07350 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ifna6P07350 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ifna6P07350 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ifna6P07350 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ifna6P07350 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ifna6P07350 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ifna6P07350 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ifna6P07350 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ifna6P07350 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ifna6P07350 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ifna6P07350 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ifna6P07350 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ifna6P07350 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ifna6P07350 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ifna6P07350 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Ifna6P07350 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Ifna6P07350 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ifna6P07350 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ifna6P07350 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ifna6P07350 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ifna6P07350 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ifna6P07350 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ifna6P07350 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ifna6P07350 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ifna6P07350 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ifna6P07350 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.6 ms