Protein–RNA interactions for Protein: P06323

T-cell receptor alpha chain V region CTL-F3, mousemouse

Predictions only

Length 132 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P06323 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
P06323 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
P06323 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
P06323 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
P06323 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
P06323 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
P06323 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
P06323 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
P06323 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
P06323 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
P06323 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
P06323 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
P06323 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
P06323 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
P06323 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
P06323 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
P06323 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
P06323 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
P06323 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
P06323 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
P06323 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
P06323 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
P06323 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
P06323 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
P06323 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
P06323 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
P06323 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
P06323 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
P06323 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
P06323 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
P06323 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
P06323 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
P06323 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
P06323 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
P06323 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
P06323 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
P06323 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
P06323 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
P06323 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
P06323 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
P06323 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
P06323 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
P06323 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
P06323 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
P06323 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
P06323 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
P06323 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
P06323 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
P06323 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
P06323 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
P06323 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
P06323 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
P06323 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
P06323 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
P06323 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
P06323 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
P06323 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
P06323 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
P06323 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
P06323 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
P06323 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
P06323 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
P06323 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
P06323 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
P06323 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
P06323 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
P06323 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
P06323 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
P06323 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
P06323 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
P06323 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
P06323 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
P06323 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
P06323 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
P06323 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
P06323 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
P06323 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
P06323 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
P06323 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
P06323 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
P06323 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
P06323 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
P06323 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
P06323 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
P06323 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
P06323 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
P06323 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
P06323 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
P06323 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
P06323 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
P06323 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
P06323 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
P06323 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
P06323 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
P06323 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
P06323 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
P06323 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
P06323 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
P06323 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
P06323 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.7 ms