Protein–RNA interactions for Protein: P01789

Ig heavy chain V region M603, mousemouse

Predictions only

Length 122 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01789 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
P01789 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
P01789 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
P01789 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
P01789 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
P01789 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
P01789 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
P01789 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
P01789 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
P01789 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
P01789 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
P01789 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
P01789 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
P01789 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
P01789 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
P01789 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
P01789 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
P01789 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
P01789 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
P01789 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
P01789 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
P01789 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
P01789 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
P01789 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
P01789 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
P01789 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
P01789 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
P01789 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
P01789 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
P01789 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
P01789 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
P01789 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
P01789 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
P01789 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
P01789 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
P01789 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
P01789 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
P01789 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
P01789 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
P01789 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
P01789 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
P01789 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
P01789 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
P01789 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
P01789 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
P01789 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
P01789 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
P01789 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
P01789 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
P01789 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
P01789 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
P01789 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
P01789 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
P01789 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
P01789 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
P01789 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
P01789 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
P01789 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
P01789 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
P01789 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
P01789 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
P01789 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
P01789 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
P01789 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
P01789 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
P01789 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
P01789 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
P01789 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
P01789 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
P01789 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
P01789 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
P01789 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
P01789 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
P01789 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
P01789 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
P01789 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
P01789 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
P01789 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
P01789 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
P01789 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
P01789 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
P01789 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
P01789 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
P01789 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
P01789 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
P01789 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
P01789 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
P01789 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
P01789 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
P01789 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
P01789 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
P01789 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
P01789 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
P01789 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
P01789 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
P01789 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
P01789 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
P01789 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
P01789 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
P01789 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.1 ms