Protein–RNA interactions for Protein: P01787

Ig heavy chain V regions TEPC 15/S107/HPCM1/HPCM2/HPCM3, mousemouse

Predictions only

Length 123 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01787 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
P01787 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
P01787 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
P01787 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
P01787 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
P01787 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
P01787 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
P01787 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
P01787 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
P01787 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
P01787 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
P01787 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
P01787 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
P01787 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
P01787 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
P01787 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
P01787 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
P01787 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
P01787 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
P01787 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
P01787 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
P01787 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
P01787 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
P01787 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
P01787 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
P01787 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
P01787 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
P01787 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
P01787 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
P01787 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
P01787 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
P01787 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
P01787 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
P01787 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
P01787 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
P01787 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
P01787 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
P01787 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
P01787 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
P01787 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
P01787 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
P01787 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
P01787 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
P01787 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
P01787 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
P01787 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
P01787 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
P01787 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
P01787 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
P01787 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
P01787 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
P01787 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
P01787 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
P01787 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
P01787 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
P01787 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
P01787 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
P01787 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
P01787 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
P01787 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
P01787 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
P01787 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
P01787 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
P01787 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
P01787 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
P01787 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
P01787 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
P01787 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
P01787 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
P01787 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
P01787 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
P01787 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
P01787 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
P01787 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
P01787 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
P01787 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
P01787 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
P01787 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
P01787 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
P01787 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
P01787 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
P01787 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
P01787 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
P01787 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
P01787 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
P01787 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
P01787 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
P01787 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
P01787 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
P01787 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
P01787 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
P01787 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
P01787 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
P01787 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
P01787 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
P01787 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
P01787 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
P01787 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
P01787 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
P01787 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.1 ms