Protein–RNA interactions for Protein: O89090

Sp1, Transcription factor Sp1, mousemouse

Predictions only

Length 784 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sp1O89090 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Sp1O89090 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Sp1O89090 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Sp1O89090 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Sp1O89090 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Sp1O89090 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Sp1O89090 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Sp1O89090 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Sp1O89090 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Sp1O89090 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Sp1O89090 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Sp1O89090 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Sp1O89090 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Sp1O89090 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Sp1O89090 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Sp1O89090 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Sp1O89090 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Sp1O89090 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Sp1O89090 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Sp1O89090 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Sp1O89090 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Sp1O89090 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
Sp1O89090 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
Sp1O89090 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Sp1O89090 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Sp1O89090 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Sp1O89090 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Sp1O89090 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Sp1O89090 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Sp1O89090 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Sp1O89090 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Sp1O89090 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Sp1O89090 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Sp1O89090 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
Sp1O89090 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Sp1O89090 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Sp1O89090 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Sp1O89090 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Sp1O89090 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Sp1O89090 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Sp1O89090 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
Sp1O89090 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Sp1O89090 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Sp1O89090 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Sp1O89090 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Sp1O89090 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Sp1O89090 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Sp1O89090 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Sp1O89090 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Sp1O89090 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
Sp1O89090 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Sp1O89090 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Sp1O89090 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Sp1O89090 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Sp1O89090 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Sp1O89090 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Sp1O89090 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Sp1O89090 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Sp1O89090 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Sp1O89090 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Sp1O89090 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Sp1O89090 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
Sp1O89090 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Sp1O89090 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Sp1O89090 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Sp1O89090 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Sp1O89090 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Sp1O89090 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Sp1O89090 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Sp1O89090 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Sp1O89090 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Sp1O89090 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Sp1O89090 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Sp1O89090 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Sp1O89090 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
Sp1O89090 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Sp1O89090 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
Sp1O89090 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Sp1O89090 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Sp1O89090 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Sp1O89090 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Sp1O89090 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Sp1O89090 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Sp1O89090 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Sp1O89090 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Sp1O89090 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Sp1O89090 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Sp1O89090 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Sp1O89090 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Sp1O89090 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Sp1O89090 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Sp1O89090 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Sp1O89090 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Sp1O89090 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Sp1O89090 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Sp1O89090 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Sp1O89090 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Sp1O89090 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Sp1O89090 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Sp1O89090 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.7 ms