Protein–RNA interactions for Protein: O54887

Tsks, Testis-specific serine kinase substrate, mousemouse

Predictions only

Length 585 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TsksO54887 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TsksO54887 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TsksO54887 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TsksO54887 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TsksO54887 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TsksO54887 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
TsksO54887 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
TsksO54887 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TsksO54887 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TsksO54887 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TsksO54887 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TsksO54887 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
TsksO54887 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC24.15■■□□□ 1.46
TsksO54887 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TsksO54887 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
TsksO54887 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
TsksO54887 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TsksO54887 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TsksO54887 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TsksO54887 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
TsksO54887 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
TsksO54887 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
TsksO54887 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
TsksO54887 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
TsksO54887 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TsksO54887 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
TsksO54887 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
TsksO54887 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
TsksO54887 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TsksO54887 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TsksO54887 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TsksO54887 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TsksO54887 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TsksO54887 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TsksO54887 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TsksO54887 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
TsksO54887 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
TsksO54887 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
TsksO54887 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TsksO54887 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TsksO54887 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TsksO54887 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TsksO54887 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TsksO54887 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TsksO54887 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TsksO54887 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
TsksO54887 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TsksO54887 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TsksO54887 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TsksO54887 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TsksO54887 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
TsksO54887 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TsksO54887 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TsksO54887 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
TsksO54887 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TsksO54887 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TsksO54887 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TsksO54887 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TsksO54887 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TsksO54887 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
TsksO54887 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TsksO54887 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
TsksO54887 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TsksO54887 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TsksO54887 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
TsksO54887 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TsksO54887 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
TsksO54887 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TsksO54887 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TsksO54887 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
TsksO54887 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TsksO54887 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
TsksO54887 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
TsksO54887 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
TsksO54887 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC24.09■■□□□ 1.45
TsksO54887 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TsksO54887 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
TsksO54887 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TsksO54887 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TsksO54887 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TsksO54887 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
TsksO54887 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
TsksO54887 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TsksO54887 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TsksO54887 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TsksO54887 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TsksO54887 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
TsksO54887 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TsksO54887 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TsksO54887 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TsksO54887 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
TsksO54887 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC24.06■■□□□ 1.44
TsksO54887 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
TsksO54887 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC24.06■■□□□ 1.44
TsksO54887 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
TsksO54887 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TsksO54887 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TsksO54887 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
TsksO54887 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
TsksO54887 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.8 ms