Protein–RNA interactions for Protein: E9Q5K9

Ythdc1, YTH domain-containing protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 736 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ythdc1E9Q5K9 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Ythdc1E9Q5K9 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Ythdc1E9Q5K9 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Ythdc1E9Q5K9 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Ythdc1E9Q5K9 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Ythdc1E9Q5K9 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Ythdc1E9Q5K9 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Ythdc1E9Q5K9 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Ythdc1E9Q5K9 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Ythdc1E9Q5K9 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Ythdc1E9Q5K9 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Ythdc1E9Q5K9 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Ythdc1E9Q5K9 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Ythdc1E9Q5K9 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Ythdc1E9Q5K9 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Ythdc1E9Q5K9 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Ythdc1E9Q5K9 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Ythdc1E9Q5K9 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Ythdc1E9Q5K9 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Ythdc1E9Q5K9 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Ythdc1E9Q5K9 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Ythdc1E9Q5K9 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Ythdc1E9Q5K9 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Ythdc1E9Q5K9 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Ythdc1E9Q5K9 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Ythdc1E9Q5K9 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Ythdc1E9Q5K9 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Ythdc1E9Q5K9 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Ythdc1E9Q5K9 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Ythdc1E9Q5K9 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Ythdc1E9Q5K9 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Ythdc1E9Q5K9 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Ythdc1E9Q5K9 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Ythdc1E9Q5K9 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Ythdc1E9Q5K9 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Ythdc1E9Q5K9 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Ythdc1E9Q5K9 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
Ythdc1E9Q5K9 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
Ythdc1E9Q5K9 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Ythdc1E9Q5K9 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Ythdc1E9Q5K9 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Ythdc1E9Q5K9 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Ythdc1E9Q5K9 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Ythdc1E9Q5K9 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Ythdc1E9Q5K9 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Ythdc1E9Q5K9 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
Ythdc1E9Q5K9 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Ythdc1E9Q5K9 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Ythdc1E9Q5K9 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Ythdc1E9Q5K9 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
Ythdc1E9Q5K9 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Ythdc1E9Q5K9 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Ythdc1E9Q5K9 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Ythdc1E9Q5K9 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Ythdc1E9Q5K9 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Ythdc1E9Q5K9 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Ythdc1E9Q5K9 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Ythdc1E9Q5K9 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Ythdc1E9Q5K9 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Ythdc1E9Q5K9 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Ythdc1E9Q5K9 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Ythdc1E9Q5K9 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Ythdc1E9Q5K9 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Ythdc1E9Q5K9 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
Ythdc1E9Q5K9 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Ythdc1E9Q5K9 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Ythdc1E9Q5K9 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Ythdc1E9Q5K9 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Ythdc1E9Q5K9 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Ythdc1E9Q5K9 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Ythdc1E9Q5K9 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Ythdc1E9Q5K9 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Ythdc1E9Q5K9 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Ythdc1E9Q5K9 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Ythdc1E9Q5K9 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
Ythdc1E9Q5K9 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Ythdc1E9Q5K9 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Ythdc1E9Q5K9 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Ythdc1E9Q5K9 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Ythdc1E9Q5K9 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Ythdc1E9Q5K9 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Ythdc1E9Q5K9 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Ythdc1E9Q5K9 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Ythdc1E9Q5K9 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Ythdc1E9Q5K9 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Ythdc1E9Q5K9 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Ythdc1E9Q5K9 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Ythdc1E9Q5K9 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Ythdc1E9Q5K9 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Ythdc1E9Q5K9 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Ythdc1E9Q5K9 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Ythdc1E9Q5K9 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Ythdc1E9Q5K9 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
Ythdc1E9Q5K9 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
Ythdc1E9Q5K9 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Ythdc1E9Q5K9 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Ythdc1E9Q5K9 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Ythdc1E9Q5K9 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Ythdc1E9Q5K9 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Ythdc1E9Q5K9 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.8 ms