Protein–RNA interactions for Protein: E9PXF3

Gm5415, Predicted gene 5415, mousemouse

Predictions only

Length 478 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm5415E9PXF3 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Gm5415E9PXF3 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Gm5415E9PXF3 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Gm5415E9PXF3 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
Gm5415E9PXF3 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
Gm5415E9PXF3 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
Gm5415E9PXF3 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
Gm5415E9PXF3 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Gm5415E9PXF3 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Gm5415E9PXF3 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Gm5415E9PXF3 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Gm5415E9PXF3 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Gm5415E9PXF3 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Gm5415E9PXF3 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Gm5415E9PXF3 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Gm5415E9PXF3 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
Gm5415E9PXF3 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Gm5415E9PXF3 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Gm5415E9PXF3 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Gm5415E9PXF3 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Gm5415E9PXF3 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Gm5415E9PXF3 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
Gm5415E9PXF3 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Gm5415E9PXF3 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Gm5415E9PXF3 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Gm5415E9PXF3 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Gm5415E9PXF3 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Gm5415E9PXF3 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Gm5415E9PXF3 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Gm5415E9PXF3 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Gm5415E9PXF3 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Gm5415E9PXF3 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Gm5415E9PXF3 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Gm5415E9PXF3 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Gm5415E9PXF3 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
Gm5415E9PXF3 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Gm5415E9PXF3 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Gm5415E9PXF3 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Gm5415E9PXF3 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Gm5415E9PXF3 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Gm5415E9PXF3 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Gm5415E9PXF3 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Gm5415E9PXF3 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Gm5415E9PXF3 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Gm5415E9PXF3 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Gm5415E9PXF3 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Gm5415E9PXF3 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Gm5415E9PXF3 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
Gm5415E9PXF3 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Gm5415E9PXF3 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Gm5415E9PXF3 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Gm5415E9PXF3 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Gm5415E9PXF3 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Gm5415E9PXF3 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Gm5415E9PXF3 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Gm5415E9PXF3 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Gm5415E9PXF3 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Gm5415E9PXF3 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Gm5415E9PXF3 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Gm5415E9PXF3 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Gm5415E9PXF3 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Gm5415E9PXF3 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Gm5415E9PXF3 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Gm5415E9PXF3 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Gm5415E9PXF3 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
Gm5415E9PXF3 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Gm5415E9PXF3 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
Gm5415E9PXF3 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Gm5415E9PXF3 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Gm5415E9PXF3 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Gm5415E9PXF3 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Gm5415E9PXF3 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Gm5415E9PXF3 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Gm5415E9PXF3 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Gm5415E9PXF3 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Gm5415E9PXF3 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Gm5415E9PXF3 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Gm5415E9PXF3 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Gm5415E9PXF3 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Gm5415E9PXF3 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
Gm5415E9PXF3 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
Gm5415E9PXF3 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Gm5415E9PXF3 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
Gm5415E9PXF3 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Gm5415E9PXF3 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Gm5415E9PXF3 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Gm5415E9PXF3 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Gm5415E9PXF3 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Gm5415E9PXF3 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
Gm5415E9PXF3 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
Gm5415E9PXF3 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Gm5415E9PXF3 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Gm5415E9PXF3 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Gm5415E9PXF3 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Gm5415E9PXF3 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Gm5415E9PXF3 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Gm5415E9PXF3 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Gm5415E9PXF3 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Gm5415E9PXF3 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Gm5415E9PXF3 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 124 ms