Protein–RNA interactions for Protein: B4XVQ1

Phf11b, PHD finger protein 11B, mousemouse

Predictions only

Length 276 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Phf11bB4XVQ1 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Phf11bB4XVQ1 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Phf11bB4XVQ1 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Phf11bB4XVQ1 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Phf11bB4XVQ1 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Phf11bB4XVQ1 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Phf11bB4XVQ1 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Phf11bB4XVQ1 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Phf11bB4XVQ1 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Phf11bB4XVQ1 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Phf11bB4XVQ1 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Phf11bB4XVQ1 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Phf11bB4XVQ1 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Phf11bB4XVQ1 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Phf11bB4XVQ1 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Phf11bB4XVQ1 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Phf11bB4XVQ1 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Phf11bB4XVQ1 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Phf11bB4XVQ1 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Phf11bB4XVQ1 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Phf11bB4XVQ1 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Phf11bB4XVQ1 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Phf11bB4XVQ1 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Phf11bB4XVQ1 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Phf11bB4XVQ1 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Phf11bB4XVQ1 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Phf11bB4XVQ1 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Phf11bB4XVQ1 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Phf11bB4XVQ1 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Phf11bB4XVQ1 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Phf11bB4XVQ1 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Phf11bB4XVQ1 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Phf11bB4XVQ1 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Phf11bB4XVQ1 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Phf11bB4XVQ1 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Phf11bB4XVQ1 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Phf11bB4XVQ1 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Phf11bB4XVQ1 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Phf11bB4XVQ1 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Phf11bB4XVQ1 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Phf11bB4XVQ1 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Phf11bB4XVQ1 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Phf11bB4XVQ1 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Phf11bB4XVQ1 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Phf11bB4XVQ1 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Phf11bB4XVQ1 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Phf11bB4XVQ1 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Phf11bB4XVQ1 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Phf11bB4XVQ1 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Phf11bB4XVQ1 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Phf11bB4XVQ1 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Phf11bB4XVQ1 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Phf11bB4XVQ1 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Phf11bB4XVQ1 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Phf11bB4XVQ1 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Phf11bB4XVQ1 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Phf11bB4XVQ1 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Phf11bB4XVQ1 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Phf11bB4XVQ1 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Phf11bB4XVQ1 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Phf11bB4XVQ1 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Phf11bB4XVQ1 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Phf11bB4XVQ1 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Phf11bB4XVQ1 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Phf11bB4XVQ1 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Phf11bB4XVQ1 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Phf11bB4XVQ1 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Phf11bB4XVQ1 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Phf11bB4XVQ1 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Phf11bB4XVQ1 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Phf11bB4XVQ1 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Phf11bB4XVQ1 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Phf11bB4XVQ1 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Phf11bB4XVQ1 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Phf11bB4XVQ1 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Phf11bB4XVQ1 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Phf11bB4XVQ1 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Phf11bB4XVQ1 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Phf11bB4XVQ1 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Phf11bB4XVQ1 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Phf11bB4XVQ1 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC19.45■□□□□ 0.7
Phf11bB4XVQ1 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Phf11bB4XVQ1 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Phf11bB4XVQ1 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC19.45■□□□□ 0.7
Phf11bB4XVQ1 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Phf11bB4XVQ1 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Phf11bB4XVQ1 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Phf11bB4XVQ1 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Phf11bB4XVQ1 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Phf11bB4XVQ1 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Phf11bB4XVQ1 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Phf11bB4XVQ1 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Phf11bB4XVQ1 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Phf11bB4XVQ1 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Phf11bB4XVQ1 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Phf11bB4XVQ1 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
Phf11bB4XVQ1 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC19.44■□□□□ 0.7
Phf11bB4XVQ1 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Phf11bB4XVQ1 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Phf11bB4XVQ1 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
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