Protein–RNA interactions for Protein: B2RPV6

Mmrn1, Multimerin-1, mousemouse

Predictions only

Length 1,210 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mmrn1B2RPV6 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Mmrn1B2RPV6 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Mmrn1B2RPV6 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Mmrn1B2RPV6 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Mmrn1B2RPV6 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Mmrn1B2RPV6 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Mmrn1B2RPV6 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Mmrn1B2RPV6 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Mmrn1B2RPV6 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
Mmrn1B2RPV6 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Mmrn1B2RPV6 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Mmrn1B2RPV6 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Mmrn1B2RPV6 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Mmrn1B2RPV6 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
Mmrn1B2RPV6 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Mmrn1B2RPV6 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Mmrn1B2RPV6 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Mmrn1B2RPV6 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Mmrn1B2RPV6 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Mmrn1B2RPV6 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Mmrn1B2RPV6 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Mmrn1B2RPV6 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Mmrn1B2RPV6 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Mmrn1B2RPV6 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Mmrn1B2RPV6 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Mmrn1B2RPV6 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Mmrn1B2RPV6 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Mmrn1B2RPV6 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
Mmrn1B2RPV6 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Mmrn1B2RPV6 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Mmrn1B2RPV6 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Mmrn1B2RPV6 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Mmrn1B2RPV6 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Mmrn1B2RPV6 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Mmrn1B2RPV6 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.88
Mmrn1B2RPV6 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Mmrn1B2RPV6 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Mmrn1B2RPV6 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Mmrn1B2RPV6 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Mmrn1B2RPV6 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Mmrn1B2RPV6 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Mmrn1B2RPV6 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Mmrn1B2RPV6 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Mmrn1B2RPV6 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Mmrn1B2RPV6 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Mmrn1B2RPV6 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Mmrn1B2RPV6 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Mmrn1B2RPV6 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Mmrn1B2RPV6 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Mmrn1B2RPV6 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Mmrn1B2RPV6 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Mmrn1B2RPV6 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
Mmrn1B2RPV6 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Mmrn1B2RPV6 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Mmrn1B2RPV6 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Mmrn1B2RPV6 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Mmrn1B2RPV6 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Mmrn1B2RPV6 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Mmrn1B2RPV6 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Mmrn1B2RPV6 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Mmrn1B2RPV6 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Mmrn1B2RPV6 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Mmrn1B2RPV6 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Mmrn1B2RPV6 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Mmrn1B2RPV6 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Mmrn1B2RPV6 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Mmrn1B2RPV6 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Mmrn1B2RPV6 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Mmrn1B2RPV6 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Mmrn1B2RPV6 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Mmrn1B2RPV6 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Mmrn1B2RPV6 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Mmrn1B2RPV6 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Mmrn1B2RPV6 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Mmrn1B2RPV6 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Mmrn1B2RPV6 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Mmrn1B2RPV6 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Mmrn1B2RPV6 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Mmrn1B2RPV6 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Mmrn1B2RPV6 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Mmrn1B2RPV6 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Mmrn1B2RPV6 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Mmrn1B2RPV6 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Mmrn1B2RPV6 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Mmrn1B2RPV6 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Mmrn1B2RPV6 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Mmrn1B2RPV6 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Mmrn1B2RPV6 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Mmrn1B2RPV6 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Mmrn1B2RPV6 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Mmrn1B2RPV6 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Mmrn1B2RPV6 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Mmrn1B2RPV6 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Mmrn1B2RPV6 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Mmrn1B2RPV6 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Mmrn1B2RPV6 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Mmrn1B2RPV6 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Mmrn1B2RPV6 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Mmrn1B2RPV6 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Mmrn1B2RPV6 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.1 ms