Protein–RNA interactions for Protein: A7VMS3

H2-M5, Histocompatibility 2, M region locus 5, mousemouse

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Length 348 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-M5A7VMS3 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
H2-M5A7VMS3 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
H2-M5A7VMS3 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
H2-M5A7VMS3 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
H2-M5A7VMS3 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC16.93■□□□□ 0.3
H2-M5A7VMS3 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
H2-M5A7VMS3 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
H2-M5A7VMS3 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
H2-M5A7VMS3 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
H2-M5A7VMS3 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
H2-M5A7VMS3 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
H2-M5A7VMS3 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
H2-M5A7VMS3 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
H2-M5A7VMS3 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
H2-M5A7VMS3 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
H2-M5A7VMS3 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
H2-M5A7VMS3 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
H2-M5A7VMS3 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
H2-M5A7VMS3 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
H2-M5A7VMS3 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
H2-M5A7VMS3 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
H2-M5A7VMS3 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
H2-M5A7VMS3 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
H2-M5A7VMS3 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
H2-M5A7VMS3 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
H2-M5A7VMS3 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
H2-M5A7VMS3 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
H2-M5A7VMS3 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
H2-M5A7VMS3 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
H2-M5A7VMS3 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
H2-M5A7VMS3 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
H2-M5A7VMS3 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
H2-M5A7VMS3 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC16.91■□□□□ 0.3
H2-M5A7VMS3 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
H2-M5A7VMS3 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
H2-M5A7VMS3 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
H2-M5A7VMS3 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
H2-M5A7VMS3 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
H2-M5A7VMS3 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
H2-M5A7VMS3 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
H2-M5A7VMS3 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
H2-M5A7VMS3 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
H2-M5A7VMS3 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
H2-M5A7VMS3 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
H2-M5A7VMS3 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
H2-M5A7VMS3 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
H2-M5A7VMS3 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
H2-M5A7VMS3 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
H2-M5A7VMS3 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
H2-M5A7VMS3 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
H2-M5A7VMS3 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
H2-M5A7VMS3 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
H2-M5A7VMS3 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
H2-M5A7VMS3 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
H2-M5A7VMS3 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
H2-M5A7VMS3 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
H2-M5A7VMS3 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
H2-M5A7VMS3 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
H2-M5A7VMS3 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
H2-M5A7VMS3 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
H2-M5A7VMS3 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
H2-M5A7VMS3 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
H2-M5A7VMS3 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC16.89■□□□□ 0.29
H2-M5A7VMS3 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
H2-M5A7VMS3 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
H2-M5A7VMS3 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
H2-M5A7VMS3 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
H2-M5A7VMS3 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
H2-M5A7VMS3 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
H2-M5A7VMS3 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
H2-M5A7VMS3 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC16.88■□□□□ 0.29
H2-M5A7VMS3 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
H2-M5A7VMS3 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
H2-M5A7VMS3 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
H2-M5A7VMS3 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
H2-M5A7VMS3 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
H2-M5A7VMS3 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
H2-M5A7VMS3 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
H2-M5A7VMS3 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
H2-M5A7VMS3 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
H2-M5A7VMS3 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
H2-M5A7VMS3 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
H2-M5A7VMS3 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
H2-M5A7VMS3 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
H2-M5A7VMS3 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
H2-M5A7VMS3 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
H2-M5A7VMS3 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
H2-M5A7VMS3 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
H2-M5A7VMS3 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
H2-M5A7VMS3 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
H2-M5A7VMS3 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
H2-M5A7VMS3 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
H2-M5A7VMS3 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
H2-M5A7VMS3 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
H2-M5A7VMS3 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
H2-M5A7VMS3 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
H2-M5A7VMS3 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
H2-M5A7VMS3 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
H2-M5A7VMS3 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
H2-M5A7VMS3 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC16.85■□□□□ 0.29
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