Protein–RNA interactions for Protein: A0A286YDB2

4930469K13Rik, RIKEN cDNA 4930469K13 gene, mousemouse

Predictions only

Length 92 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930469K13RikA0A286YDB2 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC19.69■□□□□ 0.74
4930469K13RikA0A286YDB2 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
4930469K13RikA0A286YDB2 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
4930469K13RikA0A286YDB2 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
4930469K13RikA0A286YDB2 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
4930469K13RikA0A286YDB2 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
4930469K13RikA0A286YDB2 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
4930469K13RikA0A286YDB2 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
4930469K13RikA0A286YDB2 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
4930469K13RikA0A286YDB2 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
4930469K13RikA0A286YDB2 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
4930469K13RikA0A286YDB2 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
4930469K13RikA0A286YDB2 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
4930469K13RikA0A286YDB2 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
4930469K13RikA0A286YDB2 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
4930469K13RikA0A286YDB2 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
4930469K13RikA0A286YDB2 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
4930469K13RikA0A286YDB2 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
4930469K13RikA0A286YDB2 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
4930469K13RikA0A286YDB2 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
4930469K13RikA0A286YDB2 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
4930469K13RikA0A286YDB2 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
4930469K13RikA0A286YDB2 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
4930469K13RikA0A286YDB2 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC19.67■□□□□ 0.74
4930469K13RikA0A286YDB2 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC19.67■□□□□ 0.74
4930469K13RikA0A286YDB2 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
4930469K13RikA0A286YDB2 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
4930469K13RikA0A286YDB2 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
4930469K13RikA0A286YDB2 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
4930469K13RikA0A286YDB2 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
4930469K13RikA0A286YDB2 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC19.66■□□□□ 0.74
4930469K13RikA0A286YDB2 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
4930469K13RikA0A286YDB2 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC19.66■□□□□ 0.74
4930469K13RikA0A286YDB2 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
4930469K13RikA0A286YDB2 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
4930469K13RikA0A286YDB2 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
4930469K13RikA0A286YDB2 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
4930469K13RikA0A286YDB2 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
4930469K13RikA0A286YDB2 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
4930469K13RikA0A286YDB2 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
4930469K13RikA0A286YDB2 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
4930469K13RikA0A286YDB2 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
4930469K13RikA0A286YDB2 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
4930469K13RikA0A286YDB2 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
4930469K13RikA0A286YDB2 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
4930469K13RikA0A286YDB2 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
4930469K13RikA0A286YDB2 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
4930469K13RikA0A286YDB2 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
4930469K13RikA0A286YDB2 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
4930469K13RikA0A286YDB2 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
4930469K13RikA0A286YDB2 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
4930469K13RikA0A286YDB2 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
4930469K13RikA0A286YDB2 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
4930469K13RikA0A286YDB2 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
4930469K13RikA0A286YDB2 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
4930469K13RikA0A286YDB2 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
4930469K13RikA0A286YDB2 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
4930469K13RikA0A286YDB2 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC19.64■□□□□ 0.73
4930469K13RikA0A286YDB2 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
4930469K13RikA0A286YDB2 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
4930469K13RikA0A286YDB2 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
4930469K13RikA0A286YDB2 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
4930469K13RikA0A286YDB2 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
4930469K13RikA0A286YDB2 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
4930469K13RikA0A286YDB2 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
4930469K13RikA0A286YDB2 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
4930469K13RikA0A286YDB2 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
4930469K13RikA0A286YDB2 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
4930469K13RikA0A286YDB2 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
4930469K13RikA0A286YDB2 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
4930469K13RikA0A286YDB2 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC19.63■□□□□ 0.73
4930469K13RikA0A286YDB2 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
4930469K13RikA0A286YDB2 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
4930469K13RikA0A286YDB2 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
4930469K13RikA0A286YDB2 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
4930469K13RikA0A286YDB2 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
4930469K13RikA0A286YDB2 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
4930469K13RikA0A286YDB2 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
4930469K13RikA0A286YDB2 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
4930469K13RikA0A286YDB2 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
4930469K13RikA0A286YDB2 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
4930469K13RikA0A286YDB2 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
4930469K13RikA0A286YDB2 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
4930469K13RikA0A286YDB2 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
4930469K13RikA0A286YDB2 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
4930469K13RikA0A286YDB2 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
4930469K13RikA0A286YDB2 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
4930469K13RikA0A286YDB2 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
4930469K13RikA0A286YDB2 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
4930469K13RikA0A286YDB2 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
4930469K13RikA0A286YDB2 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
4930469K13RikA0A286YDB2 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
4930469K13RikA0A286YDB2 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
4930469K13RikA0A286YDB2 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
4930469K13RikA0A286YDB2 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
4930469K13RikA0A286YDB2 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
4930469K13RikA0A286YDB2 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
4930469K13RikA0A286YDB2 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
4930469K13RikA0A286YDB2 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
4930469K13RikA0A286YDB2 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.6 ms