Protein–RNA interactions for Protein: A0A0A6YWQ1

Trbv23, T cell receptor beta, variable V23 (Fragment), mousemouse

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Length 115 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trbv23A0A0A6YWQ1 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Trbv23A0A0A6YWQ1 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Trbv23A0A0A6YWQ1 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Trbv23A0A0A6YWQ1 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Trbv23A0A0A6YWQ1 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Trbv23A0A0A6YWQ1 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Trbv23A0A0A6YWQ1 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Trbv23A0A0A6YWQ1 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Trbv23A0A0A6YWQ1 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Trbv23A0A0A6YWQ1 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Trbv23A0A0A6YWQ1 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Trbv23A0A0A6YWQ1 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Trbv23A0A0A6YWQ1 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Trbv23A0A0A6YWQ1 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Trbv23A0A0A6YWQ1 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Trbv23A0A0A6YWQ1 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Trbv23A0A0A6YWQ1 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Trbv23A0A0A6YWQ1 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Trbv23A0A0A6YWQ1 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Trbv23A0A0A6YWQ1 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Trbv23A0A0A6YWQ1 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Trbv23A0A0A6YWQ1 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Trbv23A0A0A6YWQ1 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Trbv23A0A0A6YWQ1 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Trbv23A0A0A6YWQ1 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Trbv23A0A0A6YWQ1 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Trbv23A0A0A6YWQ1 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Trbv23A0A0A6YWQ1 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Trbv23A0A0A6YWQ1 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Trbv23A0A0A6YWQ1 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Trbv23A0A0A6YWQ1 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Trbv23A0A0A6YWQ1 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Trbv23A0A0A6YWQ1 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Trbv23A0A0A6YWQ1 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Trbv23A0A0A6YWQ1 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Trbv23A0A0A6YWQ1 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Trbv23A0A0A6YWQ1 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Trbv23A0A0A6YWQ1 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Trbv23A0A0A6YWQ1 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Trbv23A0A0A6YWQ1 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Trbv23A0A0A6YWQ1 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Trbv23A0A0A6YWQ1 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Trbv23A0A0A6YWQ1 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Trbv23A0A0A6YWQ1 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Trbv23A0A0A6YWQ1 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Trbv23A0A0A6YWQ1 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Trbv23A0A0A6YWQ1 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Trbv23A0A0A6YWQ1 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Trbv23A0A0A6YWQ1 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Trbv23A0A0A6YWQ1 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Trbv23A0A0A6YWQ1 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Trbv23A0A0A6YWQ1 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Trbv23A0A0A6YWQ1 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Trbv23A0A0A6YWQ1 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Trbv23A0A0A6YWQ1 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Trbv23A0A0A6YWQ1 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Trbv23A0A0A6YWQ1 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Trbv23A0A0A6YWQ1 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Trbv23A0A0A6YWQ1 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Trbv23A0A0A6YWQ1 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Trbv23A0A0A6YWQ1 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Trbv23A0A0A6YWQ1 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Trbv23A0A0A6YWQ1 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Trbv23A0A0A6YWQ1 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Trbv23A0A0A6YWQ1 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Trbv23A0A0A6YWQ1 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Trbv23A0A0A6YWQ1 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Trbv23A0A0A6YWQ1 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Trbv23A0A0A6YWQ1 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Trbv23A0A0A6YWQ1 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Trbv23A0A0A6YWQ1 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Trbv23A0A0A6YWQ1 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Trbv23A0A0A6YWQ1 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Trbv23A0A0A6YWQ1 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Trbv23A0A0A6YWQ1 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Trbv23A0A0A6YWQ1 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Trbv23A0A0A6YWQ1 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Trbv23A0A0A6YWQ1 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Trbv23A0A0A6YWQ1 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Trbv23A0A0A6YWQ1 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Trbv23A0A0A6YWQ1 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Trbv23A0A0A6YWQ1 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Trbv23A0A0A6YWQ1 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Trbv23A0A0A6YWQ1 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Trbv23A0A0A6YWQ1 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Trbv23A0A0A6YWQ1 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Trbv23A0A0A6YWQ1 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Trbv23A0A0A6YWQ1 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Trbv23A0A0A6YWQ1 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Trbv23A0A0A6YWQ1 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Trbv23A0A0A6YWQ1 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Trbv23A0A0A6YWQ1 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Trbv23A0A0A6YWQ1 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Trbv23A0A0A6YWQ1 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Trbv23A0A0A6YWQ1 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Trbv23A0A0A6YWQ1 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Trbv23A0A0A6YWQ1 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Trbv23A0A0A6YWQ1 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Trbv23A0A0A6YWQ1 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Trbv23A0A0A6YWQ1 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
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