Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2S7

Tsc22d3, TSC22 domain family protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 137 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tsc22d3Q9Z2S7 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Tsc22d3Q9Z2S7 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Tsc22d3Q9Z2S7 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Tsc22d3Q9Z2S7 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Tsc22d3Q9Z2S7 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Tsc22d3Q9Z2S7 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Tsc22d3Q9Z2S7 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Tsc22d3Q9Z2S7 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Tsc22d3Q9Z2S7 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Tsc22d3Q9Z2S7 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Tsc22d3Q9Z2S7 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Tsc22d3Q9Z2S7 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Tsc22d3Q9Z2S7 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Tsc22d3Q9Z2S7 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Tsc22d3Q9Z2S7 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Tsc22d3Q9Z2S7 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Tsc22d3Q9Z2S7 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Tsc22d3Q9Z2S7 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Tsc22d3Q9Z2S7 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Tsc22d3Q9Z2S7 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Tsc22d3Q9Z2S7 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Tsc22d3Q9Z2S7 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Tsc22d3Q9Z2S7 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Tsc22d3Q9Z2S7 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Tsc22d3Q9Z2S7 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Tsc22d3Q9Z2S7 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Tsc22d3Q9Z2S7 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Tsc22d3Q9Z2S7 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Tsc22d3Q9Z2S7 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Tsc22d3Q9Z2S7 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Tsc22d3Q9Z2S7 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Tsc22d3Q9Z2S7 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Tsc22d3Q9Z2S7 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Tsc22d3Q9Z2S7 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Tsc22d3Q9Z2S7 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Tsc22d3Q9Z2S7 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Tsc22d3Q9Z2S7 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Tsc22d3Q9Z2S7 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Tsc22d3Q9Z2S7 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Tsc22d3Q9Z2S7 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Tsc22d3Q9Z2S7 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Tsc22d3Q9Z2S7 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Tsc22d3Q9Z2S7 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Tsc22d3Q9Z2S7 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Tsc22d3Q9Z2S7 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Tsc22d3Q9Z2S7 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Tsc22d3Q9Z2S7 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Tsc22d3Q9Z2S7 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Tsc22d3Q9Z2S7 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Tsc22d3Q9Z2S7 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Tsc22d3Q9Z2S7 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Tsc22d3Q9Z2S7 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Tsc22d3Q9Z2S7 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Tsc22d3Q9Z2S7 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Tsc22d3Q9Z2S7 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Tsc22d3Q9Z2S7 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Tsc22d3Q9Z2S7 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Tsc22d3Q9Z2S7 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Tsc22d3Q9Z2S7 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Tsc22d3Q9Z2S7 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Tsc22d3Q9Z2S7 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Tsc22d3Q9Z2S7 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Tsc22d3Q9Z2S7 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Tsc22d3Q9Z2S7 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Tsc22d3Q9Z2S7 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Tsc22d3Q9Z2S7 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Tsc22d3Q9Z2S7 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Tsc22d3Q9Z2S7 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Tsc22d3Q9Z2S7 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Tsc22d3Q9Z2S7 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Tsc22d3Q9Z2S7 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Tsc22d3Q9Z2S7 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Tsc22d3Q9Z2S7 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Tsc22d3Q9Z2S7 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Tsc22d3Q9Z2S7 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Tsc22d3Q9Z2S7 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Tsc22d3Q9Z2S7 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Tsc22d3Q9Z2S7 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Tsc22d3Q9Z2S7 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Tsc22d3Q9Z2S7 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Tsc22d3Q9Z2S7 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Tsc22d3Q9Z2S7 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Tsc22d3Q9Z2S7 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Tsc22d3Q9Z2S7 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Tsc22d3Q9Z2S7 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Tsc22d3Q9Z2S7 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Tsc22d3Q9Z2S7 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Tsc22d3Q9Z2S7 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Tsc22d3Q9Z2S7 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Tsc22d3Q9Z2S7 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Tsc22d3Q9Z2S7 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
Tsc22d3Q9Z2S7 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Tsc22d3Q9Z2S7 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Tsc22d3Q9Z2S7 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Tsc22d3Q9Z2S7 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Tsc22d3Q9Z2S7 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Tsc22d3Q9Z2S7 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Tsc22d3Q9Z2S7 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Tsc22d3Q9Z2S7 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Tsc22d3Q9Z2S7 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 94.7 ms