Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1T1

Ap3b1, AP-3 complex subunit beta-1, mousemouse

Predictions only

Length 1,105 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ap3b1Q9Z1T1 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC41.46■■■■■ 4.23
Ap3b1Q9Z1T1 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC41.46■■■■■ 4.23
Ap3b1Q9Z1T1 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC41.46■■■■■ 4.23
Ap3b1Q9Z1T1 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC41.44■■■■■ 4.22
Ap3b1Q9Z1T1 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC41.41■■■■■ 4.22
Ap3b1Q9Z1T1 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.41■■■■■ 4.22
Ap3b1Q9Z1T1 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.41■■■■■ 4.22
Ap3b1Q9Z1T1 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.4■■■■■ 4.22
Ap3b1Q9Z1T1 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC41.4■■■■■ 4.22
Ap3b1Q9Z1T1 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC41.39■■■■■ 4.22
Ap3b1Q9Z1T1 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.39■■■■■ 4.22
Ap3b1Q9Z1T1 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.38■■■■■ 4.22
Ap3b1Q9Z1T1 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.38■■■■■ 4.21
Ap3b1Q9Z1T1 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC41.38■■■■■ 4.21
Ap3b1Q9Z1T1 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC41.37■■■■■ 4.21
Ap3b1Q9Z1T1 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC41.36■■■■■ 4.21
Ap3b1Q9Z1T1 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC41.35■■■■■ 4.21
Ap3b1Q9Z1T1 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.34■■■■■ 4.21
Ap3b1Q9Z1T1 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC41.34■■■■■ 4.21
Ap3b1Q9Z1T1 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC41.28■■■■■ 4.2
Ap3b1Q9Z1T1 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC41.27■■■■■ 4.2
Ap3b1Q9Z1T1 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.26■■■■■ 4.2
Ap3b1Q9Z1T1 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.21■■■■■ 4.19
Ap3b1Q9Z1T1 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC41.21■■■■■ 4.19
Ap3b1Q9Z1T1 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.21■■■■■ 4.19
Ap3b1Q9Z1T1 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.2■■■■■ 4.19
Ap3b1Q9Z1T1 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC41.18■■■■■ 4.18
Ap3b1Q9Z1T1 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC41.16■■■■■ 4.18
Ap3b1Q9Z1T1 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC41.13■■■■■ 4.17
Ap3b1Q9Z1T1 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.13■■■■■ 4.17
Ap3b1Q9Z1T1 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.11■■■■■ 4.17
Ap3b1Q9Z1T1 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.11■■■■■ 4.17
Ap3b1Q9Z1T1 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC41.1■■■■■ 4.17
Ap3b1Q9Z1T1 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC41.06■■■■■ 4.16
Ap3b1Q9Z1T1 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC41.04■■■■■ 4.16
Ap3b1Q9Z1T1 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.04■■■■■ 4.16
Ap3b1Q9Z1T1 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC41.03■■■■■ 4.16
Ap3b1Q9Z1T1 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC41.02■■■■■ 4.16
Ap3b1Q9Z1T1 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC40.96■■■■■ 4.15
Ap3b1Q9Z1T1 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.96■■■■■ 4.15
Ap3b1Q9Z1T1 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC40.9■■■■■ 4.14
Ap3b1Q9Z1T1 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC40.89■■■■■ 4.14
Ap3b1Q9Z1T1 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.88■■■■■ 4.13
Ap3b1Q9Z1T1 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC40.86■■■■■ 4.13
Ap3b1Q9Z1T1 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC40.86■■■■■ 4.13
Ap3b1Q9Z1T1 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.84■■■■■ 4.13
Ap3b1Q9Z1T1 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC40.82■■■■■ 4.13
Ap3b1Q9Z1T1 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.81■■■■■ 4.12
Ap3b1Q9Z1T1 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC40.77■■■■■ 4.12
Ap3b1Q9Z1T1 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.75■■■■■ 4.11
Ap3b1Q9Z1T1 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC40.74■■■■■ 4.11
Ap3b1Q9Z1T1 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.73■■■■■ 4.11
Ap3b1Q9Z1T1 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.73■■■■■ 4.11
Ap3b1Q9Z1T1 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC40.72■■■■■ 4.11
Ap3b1Q9Z1T1 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.7■■■■■ 4.11
Ap3b1Q9Z1T1 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC40.69■■■■■ 4.1
Ap3b1Q9Z1T1 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.64■■■■■ 4.1
Ap3b1Q9Z1T1 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC40.64■■■■■ 4.1
Ap3b1Q9Z1T1 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC40.62■■■■■ 4.09
Ap3b1Q9Z1T1 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.61■■■■■ 4.09
Ap3b1Q9Z1T1 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC40.6■■■■■ 4.09
Ap3b1Q9Z1T1 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.6■■■■■ 4.09
Ap3b1Q9Z1T1 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC40.59■■■■■ 4.09
Ap3b1Q9Z1T1 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.58■■■■■ 4.09
Ap3b1Q9Z1T1 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC40.57■■■■■ 4.09
Ap3b1Q9Z1T1 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC40.57■■■■■ 4.09
Ap3b1Q9Z1T1 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC40.55■■■■■ 4.08
Ap3b1Q9Z1T1 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC40.55■■■■■ 4.08
Ap3b1Q9Z1T1 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.53■■■■■ 4.08
Ap3b1Q9Z1T1 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC40.52■■■■■ 4.08
Ap3b1Q9Z1T1 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC40.52■■■■■ 4.08
Ap3b1Q9Z1T1 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC40.51■■■■■ 4.08
Ap3b1Q9Z1T1 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC40.5■■■■■ 4.07
Ap3b1Q9Z1T1 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC40.48■■■■■ 4.07
Ap3b1Q9Z1T1 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC40.46■■■■■ 4.07
Ap3b1Q9Z1T1 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC40.45■■■■■ 4.07
Ap3b1Q9Z1T1 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC40.45■■■■■ 4.07
Ap3b1Q9Z1T1 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.43■■■■■ 4.06
Ap3b1Q9Z1T1 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.42■■■■■ 4.06
Ap3b1Q9Z1T1 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC40.41■■■■■ 4.06
Ap3b1Q9Z1T1 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.39■■■■■ 4.06
Ap3b1Q9Z1T1 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.38■■■■■ 4.05
Ap3b1Q9Z1T1 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.38■■■■■ 4.05
Ap3b1Q9Z1T1 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC40.37■■■■■ 4.05
Ap3b1Q9Z1T1 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC40.37■■■■■ 4.05
Ap3b1Q9Z1T1 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.37■■■■■ 4.05
Ap3b1Q9Z1T1 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.35■■■■■ 4.05
Ap3b1Q9Z1T1 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC40.34■■■■■ 4.05
Ap3b1Q9Z1T1 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.32■■■■■ 4.04
Ap3b1Q9Z1T1 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.31■■■■■ 4.04
Ap3b1Q9Z1T1 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.31■■■■■ 4.04
Ap3b1Q9Z1T1 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC40.3■■■■■ 4.04
Ap3b1Q9Z1T1 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC40.3■■■■■ 4.04
Ap3b1Q9Z1T1 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC40.3■■■■■ 4.04
Ap3b1Q9Z1T1 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.28■■■■■ 4.04
Ap3b1Q9Z1T1 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.27■■■■■ 4.04
Ap3b1Q9Z1T1 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.25■■■■■ 4.03
Ap3b1Q9Z1T1 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC40.24■■■■■ 4.03
Ap3b1Q9Z1T1 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC40.24■■■■■ 4.03
Ap3b1Q9Z1T1 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC40.21■■■■■ 4.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.4 ms