Protein–RNA interactions for Protein: Q9WVG9

Msl3, Male-specific lethal 3 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 525 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Msl3Q9WVG9 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
Msl3Q9WVG9 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
Msl3Q9WVG9 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC28.99■■■□□ 2.23
Msl3Q9WVG9 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
Msl3Q9WVG9 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC28.94■■■□□ 2.22
Msl3Q9WVG9 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Msl3Q9WVG9 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC28.93■■■□□ 2.22
Msl3Q9WVG9 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Msl3Q9WVG9 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC28.93■■■□□ 2.22
Msl3Q9WVG9 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
Msl3Q9WVG9 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC28.89■■■□□ 2.22
Msl3Q9WVG9 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Msl3Q9WVG9 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
Msl3Q9WVG9 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Msl3Q9WVG9 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Msl3Q9WVG9 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Msl3Q9WVG9 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
Msl3Q9WVG9 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC28.81■■■□□ 2.2
Msl3Q9WVG9 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
Msl3Q9WVG9 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
Msl3Q9WVG9 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
Msl3Q9WVG9 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Msl3Q9WVG9 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Msl3Q9WVG9 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Msl3Q9WVG9 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
Msl3Q9WVG9 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
Msl3Q9WVG9 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
Msl3Q9WVG9 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
Msl3Q9WVG9 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC28.65■■■□□ 2.18
Msl3Q9WVG9 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.18
Msl3Q9WVG9 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
Msl3Q9WVG9 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
Msl3Q9WVG9 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
Msl3Q9WVG9 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Msl3Q9WVG9 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Msl3Q9WVG9 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Msl3Q9WVG9 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Msl3Q9WVG9 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
Msl3Q9WVG9 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Msl3Q9WVG9 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
Msl3Q9WVG9 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
Msl3Q9WVG9 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
Msl3Q9WVG9 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC28.5■■■□□ 2.15
Msl3Q9WVG9 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
Msl3Q9WVG9 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Msl3Q9WVG9 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Msl3Q9WVG9 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Msl3Q9WVG9 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Msl3Q9WVG9 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Msl3Q9WVG9 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
Msl3Q9WVG9 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Msl3Q9WVG9 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Msl3Q9WVG9 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC28.43■■■□□ 2.14
Msl3Q9WVG9 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Msl3Q9WVG9 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
Msl3Q9WVG9 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Msl3Q9WVG9 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Msl3Q9WVG9 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Msl3Q9WVG9 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
Msl3Q9WVG9 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Msl3Q9WVG9 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Msl3Q9WVG9 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
Msl3Q9WVG9 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
Msl3Q9WVG9 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC28.34■■■□□ 2.13
Msl3Q9WVG9 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Msl3Q9WVG9 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Msl3Q9WVG9 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
Msl3Q9WVG9 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Msl3Q9WVG9 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.28■■■□□ 2.12
Msl3Q9WVG9 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC28.28■■■□□ 2.12
Msl3Q9WVG9 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Msl3Q9WVG9 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Msl3Q9WVG9 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Msl3Q9WVG9 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
Msl3Q9WVG9 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Msl3Q9WVG9 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Msl3Q9WVG9 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
Msl3Q9WVG9 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Msl3Q9WVG9 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
Msl3Q9WVG9 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
Msl3Q9WVG9 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC28.2■■■□□ 2.1
Msl3Q9WVG9 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Msl3Q9WVG9 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
Msl3Q9WVG9 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
Msl3Q9WVG9 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC28.17■■■□□ 2.1
Msl3Q9WVG9 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Msl3Q9WVG9 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC28.15■■■□□ 2.1
Msl3Q9WVG9 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
Msl3Q9WVG9 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
Msl3Q9WVG9 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Msl3Q9WVG9 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Msl3Q9WVG9 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
Msl3Q9WVG9 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Msl3Q9WVG9 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Msl3Q9WVG9 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC28.1■■■□□ 2.09
Msl3Q9WVG9 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
Msl3Q9WVG9 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Msl3Q9WVG9 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Msl3Q9WVG9 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Msl3Q9WVG9 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 8.5 ms