Protein–RNA interactions for Protein: Q9WU20

Mthfr, Methylenetetrahydrofolate reductase, mousemouse

Predictions only

Length 654 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MthfrQ9WU20 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
MthfrQ9WU20 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
MthfrQ9WU20 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
MthfrQ9WU20 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
MthfrQ9WU20 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
MthfrQ9WU20 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
MthfrQ9WU20 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
MthfrQ9WU20 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
MthfrQ9WU20 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
MthfrQ9WU20 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
MthfrQ9WU20 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
MthfrQ9WU20 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
MthfrQ9WU20 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
MthfrQ9WU20 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
MthfrQ9WU20 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
MthfrQ9WU20 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
MthfrQ9WU20 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
MthfrQ9WU20 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
MthfrQ9WU20 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
MthfrQ9WU20 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
MthfrQ9WU20 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
MthfrQ9WU20 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
MthfrQ9WU20 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
MthfrQ9WU20 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
MthfrQ9WU20 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
MthfrQ9WU20 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
MthfrQ9WU20 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
MthfrQ9WU20 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
MthfrQ9WU20 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
MthfrQ9WU20 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
MthfrQ9WU20 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
MthfrQ9WU20 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
MthfrQ9WU20 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
MthfrQ9WU20 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
MthfrQ9WU20 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
MthfrQ9WU20 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
MthfrQ9WU20 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
MthfrQ9WU20 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
MthfrQ9WU20 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
MthfrQ9WU20 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
MthfrQ9WU20 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
MthfrQ9WU20 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
MthfrQ9WU20 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
MthfrQ9WU20 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
MthfrQ9WU20 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
MthfrQ9WU20 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
MthfrQ9WU20 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
MthfrQ9WU20 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
MthfrQ9WU20 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
MthfrQ9WU20 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
MthfrQ9WU20 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
MthfrQ9WU20 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
MthfrQ9WU20 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
MthfrQ9WU20 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
MthfrQ9WU20 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
MthfrQ9WU20 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
MthfrQ9WU20 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
MthfrQ9WU20 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
MthfrQ9WU20 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
MthfrQ9WU20 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
MthfrQ9WU20 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
MthfrQ9WU20 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
MthfrQ9WU20 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
MthfrQ9WU20 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
MthfrQ9WU20 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
MthfrQ9WU20 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
MthfrQ9WU20 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
MthfrQ9WU20 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
MthfrQ9WU20 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
MthfrQ9WU20 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
MthfrQ9WU20 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
MthfrQ9WU20 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
MthfrQ9WU20 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
MthfrQ9WU20 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
MthfrQ9WU20 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
MthfrQ9WU20 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
MthfrQ9WU20 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
MthfrQ9WU20 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
MthfrQ9WU20 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
MthfrQ9WU20 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
MthfrQ9WU20 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
MthfrQ9WU20 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
MthfrQ9WU20 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
MthfrQ9WU20 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
MthfrQ9WU20 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
MthfrQ9WU20 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
MthfrQ9WU20 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
MthfrQ9WU20 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
MthfrQ9WU20 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
MthfrQ9WU20 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
MthfrQ9WU20 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
MthfrQ9WU20 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
MthfrQ9WU20 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
MthfrQ9WU20 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
MthfrQ9WU20 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
MthfrQ9WU20 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
MthfrQ9WU20 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
MthfrQ9WU20 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
MthfrQ9WU20 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
MthfrQ9WU20 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 9.3 ms