Protein–RNA interactions for Protein: Q9WTI7

Myo1c, Unconventional myosin-Ic, mousemouse

Predictions only

Length 1,063 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Myo1cQ9WTI7 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Myo1cQ9WTI7 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Myo1cQ9WTI7 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Myo1cQ9WTI7 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
Myo1cQ9WTI7 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Myo1cQ9WTI7 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Myo1cQ9WTI7 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Myo1cQ9WTI7 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
Myo1cQ9WTI7 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Myo1cQ9WTI7 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
Myo1cQ9WTI7 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Myo1cQ9WTI7 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Myo1cQ9WTI7 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Myo1cQ9WTI7 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Myo1cQ9WTI7 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Myo1cQ9WTI7 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC26.61■■□□□ 1.85
Myo1cQ9WTI7 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Myo1cQ9WTI7 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Myo1cQ9WTI7 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Myo1cQ9WTI7 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Myo1cQ9WTI7 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Myo1cQ9WTI7 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Myo1cQ9WTI7 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Myo1cQ9WTI7 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
Myo1cQ9WTI7 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
Myo1cQ9WTI7 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
Myo1cQ9WTI7 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Myo1cQ9WTI7 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
Myo1cQ9WTI7 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Myo1cQ9WTI7 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Myo1cQ9WTI7 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Myo1cQ9WTI7 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Myo1cQ9WTI7 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Myo1cQ9WTI7 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Myo1cQ9WTI7 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Myo1cQ9WTI7 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Myo1cQ9WTI7 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Myo1cQ9WTI7 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
Myo1cQ9WTI7 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Myo1cQ9WTI7 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
Myo1cQ9WTI7 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Myo1cQ9WTI7 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC26.4■■□□□ 1.82
Myo1cQ9WTI7 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Myo1cQ9WTI7 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Myo1cQ9WTI7 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
Myo1cQ9WTI7 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
Myo1cQ9WTI7 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.81
Myo1cQ9WTI7 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Myo1cQ9WTI7 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Myo1cQ9WTI7 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Myo1cQ9WTI7 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Myo1cQ9WTI7 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Myo1cQ9WTI7 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC26.33■■□□□ 1.81
Myo1cQ9WTI7 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Myo1cQ9WTI7 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC26.32■■□□□ 1.8
Myo1cQ9WTI7 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Myo1cQ9WTI7 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Myo1cQ9WTI7 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Myo1cQ9WTI7 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC26.29■■□□□ 1.8
Myo1cQ9WTI7 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Myo1cQ9WTI7 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Myo1cQ9WTI7 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Myo1cQ9WTI7 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Myo1cQ9WTI7 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Myo1cQ9WTI7 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
Myo1cQ9WTI7 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Myo1cQ9WTI7 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
Myo1cQ9WTI7 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
Myo1cQ9WTI7 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.79
Myo1cQ9WTI7 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
Myo1cQ9WTI7 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Myo1cQ9WTI7 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Myo1cQ9WTI7 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
Myo1cQ9WTI7 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Myo1cQ9WTI7 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Myo1cQ9WTI7 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
Myo1cQ9WTI7 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC26.17■■□□□ 1.78
Myo1cQ9WTI7 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Myo1cQ9WTI7 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Myo1cQ9WTI7 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Myo1cQ9WTI7 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Myo1cQ9WTI7 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC26.14■■□□□ 1.77
Myo1cQ9WTI7 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Myo1cQ9WTI7 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Myo1cQ9WTI7 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
Myo1cQ9WTI7 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Myo1cQ9WTI7 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
Myo1cQ9WTI7 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Myo1cQ9WTI7 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Myo1cQ9WTI7 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Myo1cQ9WTI7 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Myo1cQ9WTI7 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Myo1cQ9WTI7 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
Myo1cQ9WTI7 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Myo1cQ9WTI7 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Myo1cQ9WTI7 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Myo1cQ9WTI7 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Myo1cQ9WTI7 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Myo1cQ9WTI7 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Myo1cQ9WTI7 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.5 ms