Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZS0

Col4a3, Collagen alpha-3(IV) chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,669 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col4a3Q9QZS0 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC29,4■■■□□ 2,3
Col4a3Q9QZS0 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,4■■■□□ 2,3
Col4a3Q9QZS0 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC29,39■■■□□ 2,3
Col4a3Q9QZS0 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC29,38■■■□□ 2,29
Col4a3Q9QZS0 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29,37■■■□□ 2,29
Col4a3Q9QZS0 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC29,35■■■□□ 2,29
Col4a3Q9QZS0 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29,35■■■□□ 2,29
Col4a3Q9QZS0 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,34■■■□□ 2,29
Col4a3Q9QZS0 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC29,34■■■□□ 2,29
Col4a3Q9QZS0 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,33■■■□□ 2,29
Col4a3Q9QZS0 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC29,29■■■□□ 2,28
Col4a3Q9QZS0 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,29■■■□□ 2,28
Col4a3Q9QZS0 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,27■■■□□ 2,28
Col4a3Q9QZS0 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,27■■■□□ 2,28
Col4a3Q9QZS0 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC29,25■■■□□ 2,27
Col4a3Q9QZS0 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,25■■■□□ 2,27
Col4a3Q9QZS0 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC29,23■■■□□ 2,27
Col4a3Q9QZS0 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC29,23■■■□□ 2,27
Col4a3Q9QZS0 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC29,23■■■□□ 2,27
Col4a3Q9QZS0 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,23■■■□□ 2,27
Col4a3Q9QZS0 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC29,21■■■□□ 2,27
Col4a3Q9QZS0 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,18■■■□□ 2,26
Col4a3Q9QZS0 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,16■■■□□ 2,26
Col4a3Q9QZS0 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29,15■■■□□ 2,26
Col4a3Q9QZS0 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC29,13■■■□□ 2,25
Col4a3Q9QZS0 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC29,13■■■□□ 2,25
Col4a3Q9QZS0 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC29,13■■■□□ 2,25
Col4a3Q9QZS0 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29,12■■■□□ 2,25
Col4a3Q9QZS0 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,11■■■□□ 2,25
Col4a3Q9QZS0 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC29,11■■■□□ 2,25
Col4a3Q9QZS0 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,11■■■□□ 2,25
Col4a3Q9QZS0 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC29,1■■■□□ 2,25
Col4a3Q9QZS0 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,09■■■□□ 2,25
Col4a3Q9QZS0 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC29,07■■■□□ 2,24
Col4a3Q9QZS0 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,06■■■□□ 2,24
Col4a3Q9QZS0 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC29,03■■■□□ 2,24
Col4a3Q9QZS0 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,97■■■□□ 2,23
Col4a3Q9QZS0 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,96■■■□□ 2,23
Col4a3Q9QZS0 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28,96■■■□□ 2,23
Col4a3Q9QZS0 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC28,96■■■□□ 2,23
Col4a3Q9QZS0 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28,93■■■□□ 2,22
Col4a3Q9QZS0 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC28,93■■■□□ 2,22
Col4a3Q9QZS0 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC28,92■■■□□ 2,22
Col4a3Q9QZS0 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC28,92■■■□□ 2,22
Col4a3Q9QZS0 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC28,92■■■□□ 2,22
Col4a3Q9QZS0 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,91■■■□□ 2,22
Col4a3Q9QZS0 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28,91■■■□□ 2,22
Col4a3Q9QZS0 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28,9■■■□□ 2,22
Col4a3Q9QZS0 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC28,88■■■□□ 2,21
Col4a3Q9QZS0 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,88■■■□□ 2,21
Col4a3Q9QZS0 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28,88■■■□□ 2,21
Col4a3Q9QZS0 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,87■■■□□ 2,21
Col4a3Q9QZS0 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC28,86■■■□□ 2,21
Col4a3Q9QZS0 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,84■■■□□ 2,21
Col4a3Q9QZS0 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,84■■■□□ 2,21
Col4a3Q9QZS0 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28,83■■■□□ 2,21
Col4a3Q9QZS0 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,82■■■□□ 2,2
Col4a3Q9QZS0 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC28,82■■■□□ 2,2
Col4a3Q9QZS0 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,81■■■□□ 2,2
Col4a3Q9QZS0 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,81■■■□□ 2,2
Col4a3Q9QZS0 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,76■■■□□ 2,19
Col4a3Q9QZS0 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC28,75■■■□□ 2,19
Col4a3Q9QZS0 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,74■■■□□ 2,19
Col4a3Q9QZS0 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28,74■■■□□ 2,19
Col4a3Q9QZS0 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC28,74■■■□□ 2,19
Col4a3Q9QZS0 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC28,73■■■□□ 2,19
Col4a3Q9QZS0 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC28,73■■■□□ 2,19
Col4a3Q9QZS0 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC28,68■■■□□ 2,18
Col4a3Q9QZS0 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,66■■■□□ 2,18
Col4a3Q9QZS0 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,66■■■□□ 2,18
Col4a3Q9QZS0 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC28,64■■■□□ 2,17
Col4a3Q9QZS0 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28,62■■■□□ 2,17
Col4a3Q9QZS0 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC28,61■■■□□ 2,17
Col4a3Q9QZS0 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC28,61■■■□□ 2,17
Col4a3Q9QZS0 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC28,6■■■□□ 2,17
Col4a3Q9QZS0 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,6■■■□□ 2,17
Col4a3Q9QZS0 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,6■■■□□ 2,17
Col4a3Q9QZS0 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC28,59■■■□□ 2,17
Col4a3Q9QZS0 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC28,59■■■□□ 2,17
Col4a3Q9QZS0 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC28,59■■■□□ 2,17
Col4a3Q9QZS0 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28,58■■■□□ 2,17
Col4a3Q9QZS0 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,57■■■□□ 2,16
Col4a3Q9QZS0 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC28,56■■■□□ 2,16
Col4a3Q9QZS0 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC28,56■■■□□ 2,16
Col4a3Q9QZS0 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC28,54■■■□□ 2,16
Col4a3Q9QZS0 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC28,54■■■□□ 2,16
Col4a3Q9QZS0 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28,53■■■□□ 2,16
Col4a3Q9QZS0 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,52■■■□□ 2,16
Col4a3Q9QZS0 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,52■■■□□ 2,16
Col4a3Q9QZS0 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28,52■■■□□ 2,16
Col4a3Q9QZS0 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,52■■■□□ 2,16
Col4a3Q9QZS0 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28,51■■■□□ 2,16
Col4a3Q9QZS0 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC28,5■■■□□ 2,15
Col4a3Q9QZS0 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,5■■■□□ 2,15
Col4a3Q9QZS0 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,49■■■□□ 2,15
Col4a3Q9QZS0 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28,48■■■□□ 2,15
Col4a3Q9QZS0 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,48■■■□□ 2,15
Col4a3Q9QZS0 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28,48■■■□□ 2,15
Col4a3Q9QZS0 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28,47■■■□□ 2,15
Col4a3Q9QZS0 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28,47■■■□□ 2,15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10,5 ms