Protein–RNA interactions for Protein: Q9QY61

Irx4, Iroquois-class homeodomain protein IRX-4, mousemouse

Predictions only

Length 515 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irx4Q9QY61 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
Irx4Q9QY61 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
Irx4Q9QY61 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Irx4Q9QY61 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Irx4Q9QY61 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Irx4Q9QY61 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Irx4Q9QY61 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Irx4Q9QY61 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Irx4Q9QY61 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC28.46■■■□□ 2.15
Irx4Q9QY61 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Irx4Q9QY61 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Irx4Q9QY61 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Irx4Q9QY61 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Irx4Q9QY61 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Irx4Q9QY61 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Irx4Q9QY61 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
Irx4Q9QY61 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Irx4Q9QY61 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Irx4Q9QY61 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Irx4Q9QY61 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC28.32■■■□□ 2.12
Irx4Q9QY61 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Irx4Q9QY61 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Irx4Q9QY61 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Irx4Q9QY61 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Irx4Q9QY61 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Irx4Q9QY61 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC28.27■■■□□ 2.12
Irx4Q9QY61 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Irx4Q9QY61 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Irx4Q9QY61 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Irx4Q9QY61 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
Irx4Q9QY61 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
Irx4Q9QY61 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Irx4Q9QY61 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.2■■■□□ 2.1
Irx4Q9QY61 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC28.19■■■□□ 2.1
Irx4Q9QY61 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
Irx4Q9QY61 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Irx4Q9QY61 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Irx4Q9QY61 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC28.17■■■□□ 2.1
Irx4Q9QY61 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Irx4Q9QY61 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Irx4Q9QY61 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Irx4Q9QY61 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Irx4Q9QY61 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Irx4Q9QY61 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
Irx4Q9QY61 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC28.14■■■□□ 2.09
Irx4Q9QY61 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Irx4Q9QY61 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC28.12■■■□□ 2.09
Irx4Q9QY61 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Irx4Q9QY61 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Irx4Q9QY61 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC28.08■■■□□ 2.09
Irx4Q9QY61 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
Irx4Q9QY61 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
Irx4Q9QY61 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
Irx4Q9QY61 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
Irx4Q9QY61 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
Irx4Q9QY61 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Irx4Q9QY61 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Irx4Q9QY61 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
Irx4Q9QY61 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Irx4Q9QY61 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
Irx4Q9QY61 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
Irx4Q9QY61 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Irx4Q9QY61 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
Irx4Q9QY61 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Irx4Q9QY61 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
Irx4Q9QY61 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Irx4Q9QY61 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
Irx4Q9QY61 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Irx4Q9QY61 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
Irx4Q9QY61 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC27.95■■■□□ 2.06
Irx4Q9QY61 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Irx4Q9QY61 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
Irx4Q9QY61 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
Irx4Q9QY61 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Irx4Q9QY61 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Irx4Q9QY61 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Irx4Q9QY61 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Irx4Q9QY61 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Irx4Q9QY61 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Irx4Q9QY61 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
Irx4Q9QY61 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Irx4Q9QY61 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Irx4Q9QY61 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Irx4Q9QY61 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Irx4Q9QY61 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Irx4Q9QY61 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.04
Irx4Q9QY61 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Irx4Q9QY61 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC27.76■■■□□ 2.03
Irx4Q9QY61 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Irx4Q9QY61 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
Irx4Q9QY61 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Irx4Q9QY61 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Irx4Q9QY61 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
Irx4Q9QY61 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
Irx4Q9QY61 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Irx4Q9QY61 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Irx4Q9QY61 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC27.67■■■□□ 2.02
Irx4Q9QY61 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
Irx4Q9QY61 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
Irx4Q9QY61 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.7 ms