Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXS8

Cml5, Probable N-acetyltransferase CML5, mousemouse

Predictions only

Length 227 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cml5Q9QXS8 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
Cml5Q9QXS8 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Cml5Q9QXS8 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Cml5Q9QXS8 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Cml5Q9QXS8 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Cml5Q9QXS8 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Cml5Q9QXS8 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Cml5Q9QXS8 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Cml5Q9QXS8 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
Cml5Q9QXS8 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
Cml5Q9QXS8 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
Cml5Q9QXS8 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Cml5Q9QXS8 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Cml5Q9QXS8 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Cml5Q9QXS8 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Cml5Q9QXS8 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
Cml5Q9QXS8 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Cml5Q9QXS8 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Cml5Q9QXS8 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Cml5Q9QXS8 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Cml5Q9QXS8 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Cml5Q9QXS8 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Cml5Q9QXS8 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Cml5Q9QXS8 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Cml5Q9QXS8 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Cml5Q9QXS8 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Cml5Q9QXS8 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Cml5Q9QXS8 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Cml5Q9QXS8 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Cml5Q9QXS8 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Cml5Q9QXS8 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Cml5Q9QXS8 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Cml5Q9QXS8 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Cml5Q9QXS8 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Cml5Q9QXS8 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Cml5Q9QXS8 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Cml5Q9QXS8 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Cml5Q9QXS8 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Cml5Q9QXS8 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Cml5Q9QXS8 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Cml5Q9QXS8 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Cml5Q9QXS8 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Cml5Q9QXS8 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Cml5Q9QXS8 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Cml5Q9QXS8 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Cml5Q9QXS8 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Cml5Q9QXS8 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Cml5Q9QXS8 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Cml5Q9QXS8 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Cml5Q9QXS8 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Cml5Q9QXS8 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Cml5Q9QXS8 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Cml5Q9QXS8 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Cml5Q9QXS8 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Cml5Q9QXS8 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Cml5Q9QXS8 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Cml5Q9QXS8 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Cml5Q9QXS8 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Cml5Q9QXS8 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Cml5Q9QXS8 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Cml5Q9QXS8 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Cml5Q9QXS8 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Cml5Q9QXS8 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Cml5Q9QXS8 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Cml5Q9QXS8 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Cml5Q9QXS8 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Cml5Q9QXS8 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Cml5Q9QXS8 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Cml5Q9QXS8 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Cml5Q9QXS8 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Cml5Q9QXS8 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Cml5Q9QXS8 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Cml5Q9QXS8 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Cml5Q9QXS8 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Cml5Q9QXS8 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Cml5Q9QXS8 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Cml5Q9QXS8 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Cml5Q9QXS8 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Cml5Q9QXS8 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Cml5Q9QXS8 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Cml5Q9QXS8 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Cml5Q9QXS8 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Cml5Q9QXS8 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Cml5Q9QXS8 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Cml5Q9QXS8 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
Cml5Q9QXS8 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Cml5Q9QXS8 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Cml5Q9QXS8 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Cml5Q9QXS8 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Cml5Q9QXS8 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Cml5Q9QXS8 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Cml5Q9QXS8 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Cml5Q9QXS8 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Cml5Q9QXS8 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Cml5Q9QXS8 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Cml5Q9QXS8 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Cml5Q9QXS8 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Cml5Q9QXS8 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Cml5Q9QXS8 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Cml5Q9QXS8 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.7 ms