Protein–RNA interactions for Protein: Q9QVY8

Rai2, Retinoic acid-induced protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 529 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rai2Q9QVY8 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC26,36■■□□□ 1,81
Rai2Q9QVY8 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC26,36■■□□□ 1,81
Rai2Q9QVY8 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC26,34■■□□□ 1,81
Rai2Q9QVY8 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC26,33■■□□□ 1,81
Rai2Q9QVY8 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC26,33■■□□□ 1,81
Rai2Q9QVY8 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC26,32■■□□□ 1,8
Rai2Q9QVY8 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC26,3■■□□□ 1,8
Rai2Q9QVY8 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26,29■■□□□ 1,8
Rai2Q9QVY8 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26,26■■□□□ 1,79
Rai2Q9QVY8 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,26■■□□□ 1,79
Rai2Q9QVY8 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,25■■□□□ 1,79
Rai2Q9QVY8 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC26,24■■□□□ 1,79
Rai2Q9QVY8 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,22■■□□□ 1,79
Rai2Q9QVY8 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC26,22■■□□□ 1,79
Rai2Q9QVY8 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC26,21■■□□□ 1,79
Rai2Q9QVY8 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26,21■■□□□ 1,79
Rai2Q9QVY8 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26,21■■□□□ 1,79
Rai2Q9QVY8 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC26,2■■□□□ 1,78
Rai2Q9QVY8 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC26,19■■□□□ 1,78
Rai2Q9QVY8 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26,18■■□□□ 1,78
Rai2Q9QVY8 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26,16■■□□□ 1,78
Rai2Q9QVY8 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC26,16■■□□□ 1,78
Rai2Q9QVY8 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC26,15■■□□□ 1,78
Rai2Q9QVY8 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,14■■□□□ 1,78
Rai2Q9QVY8 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC26,14■■□□□ 1,78
Rai2Q9QVY8 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC26,14■■□□□ 1,78
Rai2Q9QVY8 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,14■■□□□ 1,77
Rai2Q9QVY8 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26,13■■□□□ 1,77
Rai2Q9QVY8 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC26,12■■□□□ 1,77
Rai2Q9QVY8 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC26,11■■□□□ 1,77
Rai2Q9QVY8 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,1■■□□□ 1,77
Rai2Q9QVY8 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC26,07■■□□□ 1,76
Rai2Q9QVY8 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC26,06■■□□□ 1,76
Rai2Q9QVY8 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC26,05■■□□□ 1,76
Rai2Q9QVY8 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC26,05■■□□□ 1,76
Rai2Q9QVY8 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC26,04■■□□□ 1,76
Rai2Q9QVY8 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC26,04■■□□□ 1,76
Rai2Q9QVY8 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC26,03■■□□□ 1,76
Rai2Q9QVY8 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC26,03■■□□□ 1,76
Rai2Q9QVY8 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26,02■■□□□ 1,76
Rai2Q9QVY8 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26,02■■□□□ 1,76
Rai2Q9QVY8 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26,02■■□□□ 1,76
Rai2Q9QVY8 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1,75
Rai2Q9QVY8 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1,75
Rai2Q9QVY8 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC25,99■■□□□ 1,75
Rai2Q9QVY8 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,96■■□□□ 1,75
Rai2Q9QVY8 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25,94■■□□□ 1,74
Rai2Q9QVY8 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,94■■□□□ 1,74
Rai2Q9QVY8 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC25,93■■□□□ 1,74
Rai2Q9QVY8 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,92■■□□□ 1,74
Rai2Q9QVY8 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,92■■□□□ 1,74
Rai2Q9QVY8 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25,92■■□□□ 1,74
Rai2Q9QVY8 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,92■■□□□ 1,74
Rai2Q9QVY8 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC25,9■■□□□ 1,74
Rai2Q9QVY8 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC25,88■■□□□ 1,73
Rai2Q9QVY8 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25,87■■□□□ 1,73
Rai2Q9QVY8 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25,87■■□□□ 1,73
Rai2Q9QVY8 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC25,86■■□□□ 1,73
Rai2Q9QVY8 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC25,86■■□□□ 1,73
Rai2Q9QVY8 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC25,84■■□□□ 1,73
Rai2Q9QVY8 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,84■■□□□ 1,73
Rai2Q9QVY8 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,82■■□□□ 1,72
Rai2Q9QVY8 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,81■■□□□ 1,72
Rai2Q9QVY8 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25,8■■□□□ 1,72
Rai2Q9QVY8 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC25,8■■□□□ 1,72
Rai2Q9QVY8 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC25,8■■□□□ 1,72
Rai2Q9QVY8 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC25,8■■□□□ 1,72
Rai2Q9QVY8 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC25,8■■□□□ 1,72
Rai2Q9QVY8 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,78■■□□□ 1,72
Rai2Q9QVY8 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC25,78■■□□□ 1,72
Rai2Q9QVY8 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25,77■■□□□ 1,72
Rai2Q9QVY8 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC25,77■■□□□ 1,72
Rai2Q9QVY8 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC25,76■■□□□ 1,71
Rai2Q9QVY8 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC25,76■■□□□ 1,71
Rai2Q9QVY8 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25,75■■□□□ 1,71
Rai2Q9QVY8 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25,75■■□□□ 1,71
Rai2Q9QVY8 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25,74■■□□□ 1,71
Rai2Q9QVY8 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,74■■□□□ 1,71
Rai2Q9QVY8 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25,73■■□□□ 1,71
Rai2Q9QVY8 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25,73■■□□□ 1,71
Rai2Q9QVY8 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,72■■□□□ 1,71
Rai2Q9QVY8 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC25,72■■□□□ 1,71
Rai2Q9QVY8 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,71■■□□□ 1,71
Rai2Q9QVY8 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC25,7■■□□□ 1,71
Rai2Q9QVY8 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC25,7■■□□□ 1,7
Rai2Q9QVY8 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC25,69■■□□□ 1,7
Rai2Q9QVY8 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25,67■■□□□ 1,7
Rai2Q9QVY8 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC25,67■■□□□ 1,7
Rai2Q9QVY8 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,66■■□□□ 1,7
Rai2Q9QVY8 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25,66■■□□□ 1,7
Rai2Q9QVY8 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,64■■□□□ 1,7
Rai2Q9QVY8 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25,63■■□□□ 1,69
Rai2Q9QVY8 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,62■■□□□ 1,69
Rai2Q9QVY8 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC25,62■■□□□ 1,69
Rai2Q9QVY8 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC25,62■■□□□ 1,69
Rai2Q9QVY8 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25,59■■□□□ 1,69
Rai2Q9QVY8 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,58■■□□□ 1,69
Rai2Q9QVY8 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC25,58■■□□□ 1,68
Rai2Q9QVY8 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC25,57■■□□□ 1,68
Rai2Q9QVY8 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC25,57■■□□□ 1,68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15,7 ms