Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLZ8

Sigirr, Single Ig IL-1-related receptor, mousemouse

Predictions only

Length 409 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SigirrQ9JLZ8 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC25.14■■□□□ 1.62
SigirrQ9JLZ8 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SigirrQ9JLZ8 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
SigirrQ9JLZ8 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
SigirrQ9JLZ8 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SigirrQ9JLZ8 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
SigirrQ9JLZ8 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SigirrQ9JLZ8 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SigirrQ9JLZ8 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SigirrQ9JLZ8 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SigirrQ9JLZ8 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SigirrQ9JLZ8 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SigirrQ9JLZ8 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SigirrQ9JLZ8 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
SigirrQ9JLZ8 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SigirrQ9JLZ8 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC24.98■■□□□ 1.59
SigirrQ9JLZ8 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
SigirrQ9JLZ8 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
SigirrQ9JLZ8 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
SigirrQ9JLZ8 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
SigirrQ9JLZ8 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
SigirrQ9JLZ8 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC24.93■■□□□ 1.58
SigirrQ9JLZ8 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
SigirrQ9JLZ8 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SigirrQ9JLZ8 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SigirrQ9JLZ8 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SigirrQ9JLZ8 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SigirrQ9JLZ8 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
SigirrQ9JLZ8 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
SigirrQ9JLZ8 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
SigirrQ9JLZ8 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SigirrQ9JLZ8 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SigirrQ9JLZ8 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SigirrQ9JLZ8 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SigirrQ9JLZ8 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SigirrQ9JLZ8 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
SigirrQ9JLZ8 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SigirrQ9JLZ8 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SigirrQ9JLZ8 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
SigirrQ9JLZ8 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SigirrQ9JLZ8 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
SigirrQ9JLZ8 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SigirrQ9JLZ8 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SigirrQ9JLZ8 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
SigirrQ9JLZ8 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SigirrQ9JLZ8 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
SigirrQ9JLZ8 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
SigirrQ9JLZ8 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SigirrQ9JLZ8 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SigirrQ9JLZ8 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SigirrQ9JLZ8 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
SigirrQ9JLZ8 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
SigirrQ9JLZ8 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SigirrQ9JLZ8 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
SigirrQ9JLZ8 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SigirrQ9JLZ8 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SigirrQ9JLZ8 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SigirrQ9JLZ8 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SigirrQ9JLZ8 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
SigirrQ9JLZ8 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SigirrQ9JLZ8 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
SigirrQ9JLZ8 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SigirrQ9JLZ8 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SigirrQ9JLZ8 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
SigirrQ9JLZ8 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
SigirrQ9JLZ8 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
SigirrQ9JLZ8 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SigirrQ9JLZ8 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SigirrQ9JLZ8 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SigirrQ9JLZ8 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SigirrQ9JLZ8 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SigirrQ9JLZ8 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SigirrQ9JLZ8 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SigirrQ9JLZ8 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SigirrQ9JLZ8 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SigirrQ9JLZ8 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SigirrQ9JLZ8 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SigirrQ9JLZ8 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SigirrQ9JLZ8 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SigirrQ9JLZ8 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
SigirrQ9JLZ8 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SigirrQ9JLZ8 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SigirrQ9JLZ8 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
SigirrQ9JLZ8 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SigirrQ9JLZ8 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
SigirrQ9JLZ8 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SigirrQ9JLZ8 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
SigirrQ9JLZ8 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
SigirrQ9JLZ8 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SigirrQ9JLZ8 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SigirrQ9JLZ8 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SigirrQ9JLZ8 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SigirrQ9JLZ8 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SigirrQ9JLZ8 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SigirrQ9JLZ8 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SigirrQ9JLZ8 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC24.34■■□□□ 1.49
SigirrQ9JLZ8 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC24.33■■□□□ 1.49
SigirrQ9JLZ8 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SigirrQ9JLZ8 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SigirrQ9JLZ8 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.3 ms