Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKQ4

Irx5, Iroquois-class homeodomain protein IRX-5, mousemouse

Predictions only

Length 484 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irx5Q9JKQ4 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC29,44■■■□□ 2,3
Irx5Q9JKQ4 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,43■■■□□ 2,3
Irx5Q9JKQ4 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,43■■■□□ 2,3
Irx5Q9JKQ4 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC29,4■■■□□ 2,3
Irx5Q9JKQ4 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29,4■■■□□ 2,3
Irx5Q9JKQ4 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,39■■■□□ 2,3
Irx5Q9JKQ4 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,38■■■□□ 2,29
Irx5Q9JKQ4 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29,38■■■□□ 2,29
Irx5Q9JKQ4 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,37■■■□□ 2,29
Irx5Q9JKQ4 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC29,35■■■□□ 2,29
Irx5Q9JKQ4 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,35■■■□□ 2,29
Irx5Q9JKQ4 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,33■■■□□ 2,29
Irx5Q9JKQ4 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC29,32■■■□□ 2,28
Irx5Q9JKQ4 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC29,29■■■□□ 2,28
Irx5Q9JKQ4 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC29,29■■■□□ 2,28
Irx5Q9JKQ4 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29,28■■■□□ 2,28
Irx5Q9JKQ4 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,27■■■□□ 2,28
Irx5Q9JKQ4 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,23■■■□□ 2,27
Irx5Q9JKQ4 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC29,23■■■□□ 2,27
Irx5Q9JKQ4 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29,19■■■□□ 2,26
Irx5Q9JKQ4 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC29,19■■■□□ 2,26
Irx5Q9JKQ4 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC29,15■■■□□ 2,26
Irx5Q9JKQ4 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC29,15■■■□□ 2,26
Irx5Q9JKQ4 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,14■■■□□ 2,26
Irx5Q9JKQ4 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29,12■■■□□ 2,25
Irx5Q9JKQ4 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC29,11■■■□□ 2,25
Irx5Q9JKQ4 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC29,11■■■□□ 2,25
Irx5Q9JKQ4 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29,1■■■□□ 2,25
Irx5Q9JKQ4 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,09■■■□□ 2,25
Irx5Q9JKQ4 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,09■■■□□ 2,25
Irx5Q9JKQ4 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC29,08■■■□□ 2,25
Irx5Q9JKQ4 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC29,08■■■□□ 2,25
Irx5Q9JKQ4 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,08■■■□□ 2,25
Irx5Q9JKQ4 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,05■■■□□ 2,24
Irx5Q9JKQ4 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC29,04■■■□□ 2,24
Irx5Q9JKQ4 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC28,99■■■□□ 2,23
Irx5Q9JKQ4 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC28,98■■■□□ 2,23
Irx5Q9JKQ4 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC28,96■■■□□ 2,23
Irx5Q9JKQ4 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,95■■■□□ 2,22
Irx5Q9JKQ4 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC28,93■■■□□ 2,22
Irx5Q9JKQ4 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC28,92■■■□□ 2,22
Irx5Q9JKQ4 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC28,92■■■□□ 2,22
Irx5Q9JKQ4 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28,92■■■□□ 2,22
Irx5Q9JKQ4 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,89■■■□□ 2,21
Irx5Q9JKQ4 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28,88■■■□□ 2,21
Irx5Q9JKQ4 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,87■■■□□ 2,21
Irx5Q9JKQ4 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28,84■■■□□ 2,21
Irx5Q9JKQ4 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC28,83■■■□□ 2,21
Irx5Q9JKQ4 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC28,82■■■□□ 2,2
Irx5Q9JKQ4 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC28,8■■■□□ 2,2
Irx5Q9JKQ4 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC28,79■■■□□ 2,2
Irx5Q9JKQ4 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC28,78■■■□□ 2,2
Irx5Q9JKQ4 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC28,77■■■□□ 2,2
Irx5Q9JKQ4 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,76■■■□□ 2,19
Irx5Q9JKQ4 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC28,75■■■□□ 2,19
Irx5Q9JKQ4 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC28,75■■■□□ 2,19
Irx5Q9JKQ4 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,75■■■□□ 2,19
Irx5Q9JKQ4 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28,7■■■□□ 2,18
Irx5Q9JKQ4 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC28,67■■■□□ 2,18
Irx5Q9JKQ4 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC28,67■■■□□ 2,18
Irx5Q9JKQ4 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,66■■■□□ 2,18
Irx5Q9JKQ4 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC28,64■■■□□ 2,18
Irx5Q9JKQ4 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC28,64■■■□□ 2,18
Irx5Q9JKQ4 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC28,62■■■□□ 2,17
Irx5Q9JKQ4 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,62■■■□□ 2,17
Irx5Q9JKQ4 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28,61■■■□□ 2,17
Irx5Q9JKQ4 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC28,61■■■□□ 2,17
Irx5Q9JKQ4 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28,6■■■□□ 2,17
Irx5Q9JKQ4 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC28,59■■■□□ 2,17
Irx5Q9JKQ4 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC28,59■■■□□ 2,17
Irx5Q9JKQ4 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,58■■■□□ 2,17
Irx5Q9JKQ4 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC28,57■■■□□ 2,16
Irx5Q9JKQ4 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,57■■■□□ 2,16
Irx5Q9JKQ4 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC28,54■■■□□ 2,16
Irx5Q9JKQ4 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC28,53■■■□□ 2,16
Irx5Q9JKQ4 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC28,52■■■□□ 2,16
Irx5Q9JKQ4 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC28,51■■■□□ 2,15
Irx5Q9JKQ4 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC28,49■■■□□ 2,15
Irx5Q9JKQ4 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,48■■■□□ 2,15
Irx5Q9JKQ4 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC28,47■■■□□ 2,15
Irx5Q9JKQ4 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,44■■■□□ 2,14
Irx5Q9JKQ4 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28,43■■■□□ 2,14
Irx5Q9JKQ4 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,41■■■□□ 2,14
Irx5Q9JKQ4 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC28,39■■■□□ 2,14
Irx5Q9JKQ4 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28,39■■■□□ 2,14
Irx5Q9JKQ4 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC28,38■■■□□ 2,13
Irx5Q9JKQ4 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC28,38■■■□□ 2,13
Irx5Q9JKQ4 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28,36■■■□□ 2,13
Irx5Q9JKQ4 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,36■■■□□ 2,13
Irx5Q9JKQ4 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28,36■■■□□ 2,13
Irx5Q9JKQ4 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC28,34■■■□□ 2,13
Irx5Q9JKQ4 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,33■■■□□ 2,13
Irx5Q9JKQ4 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC28,31■■■□□ 2,12
Irx5Q9JKQ4 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC28,3■■■□□ 2,12
Irx5Q9JKQ4 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC28,29■■■□□ 2,12
Irx5Q9JKQ4 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC28,29■■■□□ 2,12
Irx5Q9JKQ4 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC28,29■■■□□ 2,12
Irx5Q9JKQ4 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,29■■■□□ 2,12
Irx5Q9JKQ4 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,28■■■□□ 2,12
Irx5Q9JKQ4 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,27■■■□□ 2,12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11,2 ms