Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKQ4

Irx5, Iroquois-class homeodomain protein IRX-5, mousemouse

Predictions only

Length 484 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irx5Q9JKQ4 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
Irx5Q9JKQ4 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
Irx5Q9JKQ4 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
Irx5Q9JKQ4 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC29.4■■■□□ 2.3
Irx5Q9JKQ4 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
Irx5Q9JKQ4 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
Irx5Q9JKQ4 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
Irx5Q9JKQ4 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.38■■■□□ 2.29
Irx5Q9JKQ4 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
Irx5Q9JKQ4 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC29.35■■■□□ 2.29
Irx5Q9JKQ4 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
Irx5Q9JKQ4 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
Irx5Q9JKQ4 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
Irx5Q9JKQ4 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
Irx5Q9JKQ4 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC29.29■■■□□ 2.28
Irx5Q9JKQ4 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.28■■■□□ 2.28
Irx5Q9JKQ4 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
Irx5Q9JKQ4 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
Irx5Q9JKQ4 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
Irx5Q9JKQ4 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
Irx5Q9JKQ4 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC29.19■■■□□ 2.26
Irx5Q9JKQ4 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC29.15■■■□□ 2.26
Irx5Q9JKQ4 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC29.15■■■□□ 2.26
Irx5Q9JKQ4 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
Irx5Q9JKQ4 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.12■■■□□ 2.25
Irx5Q9JKQ4 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC29.11■■■□□ 2.25
Irx5Q9JKQ4 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC29.11■■■□□ 2.25
Irx5Q9JKQ4 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
Irx5Q9JKQ4 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
Irx5Q9JKQ4 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
Irx5Q9JKQ4 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC29.08■■■□□ 2.25
Irx5Q9JKQ4 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC29.08■■■□□ 2.25
Irx5Q9JKQ4 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Irx5Q9JKQ4 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
Irx5Q9JKQ4 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
Irx5Q9JKQ4 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC28.99■■■□□ 2.23
Irx5Q9JKQ4 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC28.98■■■□□ 2.23
Irx5Q9JKQ4 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
Irx5Q9JKQ4 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
Irx5Q9JKQ4 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Irx5Q9JKQ4 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
Irx5Q9JKQ4 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC28.92■■■□□ 2.22
Irx5Q9JKQ4 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
Irx5Q9JKQ4 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.21
Irx5Q9JKQ4 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Irx5Q9JKQ4 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
Irx5Q9JKQ4 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Irx5Q9JKQ4 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
Irx5Q9JKQ4 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC28.82■■■□□ 2.2
Irx5Q9JKQ4 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Irx5Q9JKQ4 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Irx5Q9JKQ4 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
Irx5Q9JKQ4 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC28.77■■■□□ 2.2
Irx5Q9JKQ4 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
Irx5Q9JKQ4 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC28.75■■■□□ 2.19
Irx5Q9JKQ4 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC28.75■■■□□ 2.19
Irx5Q9JKQ4 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Irx5Q9JKQ4 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
Irx5Q9JKQ4 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
Irx5Q9JKQ4 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
Irx5Q9JKQ4 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Irx5Q9JKQ4 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.18
Irx5Q9JKQ4 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.18
Irx5Q9JKQ4 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Irx5Q9JKQ4 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Irx5Q9JKQ4 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Irx5Q9JKQ4 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC28.61■■■□□ 2.17
Irx5Q9JKQ4 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
Irx5Q9JKQ4 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
Irx5Q9JKQ4 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
Irx5Q9JKQ4 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Irx5Q9JKQ4 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC28.57■■■□□ 2.16
Irx5Q9JKQ4 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Irx5Q9JKQ4 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
Irx5Q9JKQ4 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Irx5Q9JKQ4 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Irx5Q9JKQ4 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
Irx5Q9JKQ4 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
Irx5Q9JKQ4 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Irx5Q9JKQ4 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC28.47■■■□□ 2.15
Irx5Q9JKQ4 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Irx5Q9JKQ4 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Irx5Q9JKQ4 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Irx5Q9JKQ4 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC28.39■■■□□ 2.14
Irx5Q9JKQ4 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
Irx5Q9JKQ4 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
Irx5Q9JKQ4 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC28.38■■■□□ 2.13
Irx5Q9JKQ4 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.36■■■□□ 2.13
Irx5Q9JKQ4 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Irx5Q9JKQ4 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Irx5Q9JKQ4 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC28.34■■■□□ 2.13
Irx5Q9JKQ4 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Irx5Q9JKQ4 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
Irx5Q9JKQ4 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC28.3■■■□□ 2.12
Irx5Q9JKQ4 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC28.29■■■□□ 2.12
Irx5Q9JKQ4 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC28.29■■■□□ 2.12
Irx5Q9JKQ4 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
Irx5Q9JKQ4 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Irx5Q9JKQ4 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Irx5Q9JKQ4 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.9 ms