Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKF4

Clec6a, C-type lectin domain family 6 member A, mousemouse

Predictions only

Length 209 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clec6aQ9JKF4 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Clec6aQ9JKF4 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Clec6aQ9JKF4 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Clec6aQ9JKF4 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
Clec6aQ9JKF4 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Clec6aQ9JKF4 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Clec6aQ9JKF4 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Clec6aQ9JKF4 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Clec6aQ9JKF4 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Clec6aQ9JKF4 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Clec6aQ9JKF4 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Clec6aQ9JKF4 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Clec6aQ9JKF4 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Clec6aQ9JKF4 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Clec6aQ9JKF4 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Clec6aQ9JKF4 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Clec6aQ9JKF4 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Clec6aQ9JKF4 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Clec6aQ9JKF4 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Clec6aQ9JKF4 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Clec6aQ9JKF4 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Clec6aQ9JKF4 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Clec6aQ9JKF4 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Clec6aQ9JKF4 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Clec6aQ9JKF4 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Clec6aQ9JKF4 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Clec6aQ9JKF4 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Clec6aQ9JKF4 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Clec6aQ9JKF4 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Clec6aQ9JKF4 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Clec6aQ9JKF4 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Clec6aQ9JKF4 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Clec6aQ9JKF4 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Clec6aQ9JKF4 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Clec6aQ9JKF4 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Clec6aQ9JKF4 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Clec6aQ9JKF4 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Clec6aQ9JKF4 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Clec6aQ9JKF4 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Clec6aQ9JKF4 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Clec6aQ9JKF4 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Clec6aQ9JKF4 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Clec6aQ9JKF4 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Clec6aQ9JKF4 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Clec6aQ9JKF4 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
Clec6aQ9JKF4 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Clec6aQ9JKF4 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Clec6aQ9JKF4 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Clec6aQ9JKF4 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Clec6aQ9JKF4 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Clec6aQ9JKF4 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Clec6aQ9JKF4 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Clec6aQ9JKF4 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Clec6aQ9JKF4 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Clec6aQ9JKF4 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Clec6aQ9JKF4 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Clec6aQ9JKF4 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
Clec6aQ9JKF4 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Clec6aQ9JKF4 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Clec6aQ9JKF4 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Clec6aQ9JKF4 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Clec6aQ9JKF4 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Clec6aQ9JKF4 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Clec6aQ9JKF4 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Clec6aQ9JKF4 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Clec6aQ9JKF4 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Clec6aQ9JKF4 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Clec6aQ9JKF4 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Clec6aQ9JKF4 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Clec6aQ9JKF4 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Clec6aQ9JKF4 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Clec6aQ9JKF4 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Clec6aQ9JKF4 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Clec6aQ9JKF4 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Clec6aQ9JKF4 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Clec6aQ9JKF4 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Clec6aQ9JKF4 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Clec6aQ9JKF4 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Clec6aQ9JKF4 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Clec6aQ9JKF4 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Clec6aQ9JKF4 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Clec6aQ9JKF4 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Clec6aQ9JKF4 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Clec6aQ9JKF4 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Clec6aQ9JKF4 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Clec6aQ9JKF4 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Clec6aQ9JKF4 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Clec6aQ9JKF4 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Clec6aQ9JKF4 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Clec6aQ9JKF4 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Clec6aQ9JKF4 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Clec6aQ9JKF4 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Clec6aQ9JKF4 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Clec6aQ9JKF4 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Clec6aQ9JKF4 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Clec6aQ9JKF4 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Clec6aQ9JKF4 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Clec6aQ9JKF4 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Clec6aQ9JKF4 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Clec6aQ9JKF4 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 96.7 ms