Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKC7

Ap4m1, AP-4 complex subunit mu-1, mousemouse

Predictions only

Length 449 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ap4m1Q9JKC7 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ap4m1Q9JKC7 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ap4m1Q9JKC7 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ap4m1Q9JKC7 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ap4m1Q9JKC7 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ap4m1Q9JKC7 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Ap4m1Q9JKC7 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ap4m1Q9JKC7 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ap4m1Q9JKC7 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ap4m1Q9JKC7 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Ap4m1Q9JKC7 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ap4m1Q9JKC7 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ap4m1Q9JKC7 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Ap4m1Q9JKC7 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ap4m1Q9JKC7 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ap4m1Q9JKC7 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ap4m1Q9JKC7 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ap4m1Q9JKC7 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ap4m1Q9JKC7 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ap4m1Q9JKC7 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ap4m1Q9JKC7 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ap4m1Q9JKC7 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ap4m1Q9JKC7 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ap4m1Q9JKC7 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ap4m1Q9JKC7 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ap4m1Q9JKC7 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ap4m1Q9JKC7 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ap4m1Q9JKC7 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ap4m1Q9JKC7 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ap4m1Q9JKC7 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Ap4m1Q9JKC7 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ap4m1Q9JKC7 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ap4m1Q9JKC7 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ap4m1Q9JKC7 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ap4m1Q9JKC7 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
Ap4m1Q9JKC7 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ap4m1Q9JKC7 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ap4m1Q9JKC7 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ap4m1Q9JKC7 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ap4m1Q9JKC7 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ap4m1Q9JKC7 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ap4m1Q9JKC7 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ap4m1Q9JKC7 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ap4m1Q9JKC7 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ap4m1Q9JKC7 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
Ap4m1Q9JKC7 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ap4m1Q9JKC7 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ap4m1Q9JKC7 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ap4m1Q9JKC7 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ap4m1Q9JKC7 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
Ap4m1Q9JKC7 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ap4m1Q9JKC7 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ap4m1Q9JKC7 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ap4m1Q9JKC7 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ap4m1Q9JKC7 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ap4m1Q9JKC7 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ap4m1Q9JKC7 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ap4m1Q9JKC7 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ap4m1Q9JKC7 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
Ap4m1Q9JKC7 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ap4m1Q9JKC7 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ap4m1Q9JKC7 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
Ap4m1Q9JKC7 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC21.14■□□□□ 0.98
Ap4m1Q9JKC7 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Ap4m1Q9JKC7 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ap4m1Q9JKC7 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ap4m1Q9JKC7 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ap4m1Q9JKC7 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ap4m1Q9JKC7 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ap4m1Q9JKC7 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Ap4m1Q9JKC7 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Ap4m1Q9JKC7 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
Ap4m1Q9JKC7 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Ap4m1Q9JKC7 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Ap4m1Q9JKC7 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Ap4m1Q9JKC7 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Ap4m1Q9JKC7 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Ap4m1Q9JKC7 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Ap4m1Q9JKC7 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Ap4m1Q9JKC7 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Ap4m1Q9JKC7 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Ap4m1Q9JKC7 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Ap4m1Q9JKC7 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Ap4m1Q9JKC7 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Ap4m1Q9JKC7 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Ap4m1Q9JKC7 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Ap4m1Q9JKC7 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Ap4m1Q9JKC7 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Ap4m1Q9JKC7 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Ap4m1Q9JKC7 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Ap4m1Q9JKC7 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Ap4m1Q9JKC7 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Ap4m1Q9JKC7 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Ap4m1Q9JKC7 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Ap4m1Q9JKC7 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Ap4m1Q9JKC7 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Ap4m1Q9JKC7 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Ap4m1Q9JKC7 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Ap4m1Q9JKC7 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Ap4m1Q9JKC7 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16 ms