Protein–RNA interactions for Protein: Q9ET30

Tm9sf3, Transmembrane 9 superfamily member 3, mousemouse

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Length 587 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tm9sf3Q9ET30 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Tm9sf3Q9ET30 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
Tm9sf3Q9ET30 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
Tm9sf3Q9ET30 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Tm9sf3Q9ET30 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
Tm9sf3Q9ET30 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC26.08■■□□□ 1.77
Tm9sf3Q9ET30 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
Tm9sf3Q9ET30 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Tm9sf3Q9ET30 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC26.05■■□□□ 1.76
Tm9sf3Q9ET30 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Tm9sf3Q9ET30 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC26.03■■□□□ 1.76
Tm9sf3Q9ET30 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Tm9sf3Q9ET30 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Tm9sf3Q9ET30 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Tm9sf3Q9ET30 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Tm9sf3Q9ET30 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC26■■□□□ 1.75
Tm9sf3Q9ET30 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Tm9sf3Q9ET30 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
Tm9sf3Q9ET30 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Tm9sf3Q9ET30 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Tm9sf3Q9ET30 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Tm9sf3Q9ET30 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
Tm9sf3Q9ET30 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
Tm9sf3Q9ET30 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
Tm9sf3Q9ET30 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Tm9sf3Q9ET30 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Tm9sf3Q9ET30 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Tm9sf3Q9ET30 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Tm9sf3Q9ET30 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
Tm9sf3Q9ET30 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Tm9sf3Q9ET30 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
Tm9sf3Q9ET30 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
Tm9sf3Q9ET30 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Tm9sf3Q9ET30 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Tm9sf3Q9ET30 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Tm9sf3Q9ET30 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Tm9sf3Q9ET30 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Tm9sf3Q9ET30 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Tm9sf3Q9ET30 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Tm9sf3Q9ET30 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Tm9sf3Q9ET30 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Tm9sf3Q9ET30 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Tm9sf3Q9ET30 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
Tm9sf3Q9ET30 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Tm9sf3Q9ET30 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Tm9sf3Q9ET30 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Tm9sf3Q9ET30 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Tm9sf3Q9ET30 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Tm9sf3Q9ET30 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Tm9sf3Q9ET30 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Tm9sf3Q9ET30 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Tm9sf3Q9ET30 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Tm9sf3Q9ET30 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
Tm9sf3Q9ET30 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Tm9sf3Q9ET30 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Tm9sf3Q9ET30 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Tm9sf3Q9ET30 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Tm9sf3Q9ET30 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Tm9sf3Q9ET30 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Tm9sf3Q9ET30 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Tm9sf3Q9ET30 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Tm9sf3Q9ET30 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Tm9sf3Q9ET30 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Tm9sf3Q9ET30 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Tm9sf3Q9ET30 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Tm9sf3Q9ET30 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Tm9sf3Q9ET30 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Tm9sf3Q9ET30 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Tm9sf3Q9ET30 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
Tm9sf3Q9ET30 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Tm9sf3Q9ET30 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Tm9sf3Q9ET30 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Tm9sf3Q9ET30 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Tm9sf3Q9ET30 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Tm9sf3Q9ET30 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Tm9sf3Q9ET30 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Tm9sf3Q9ET30 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Tm9sf3Q9ET30 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Tm9sf3Q9ET30 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Tm9sf3Q9ET30 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Tm9sf3Q9ET30 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Tm9sf3Q9ET30 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Tm9sf3Q9ET30 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Tm9sf3Q9ET30 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Tm9sf3Q9ET30 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Tm9sf3Q9ET30 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Tm9sf3Q9ET30 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Tm9sf3Q9ET30 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Tm9sf3Q9ET30 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Tm9sf3Q9ET30 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Tm9sf3Q9ET30 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Tm9sf3Q9ET30 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Tm9sf3Q9ET30 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Tm9sf3Q9ET30 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Tm9sf3Q9ET30 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
Tm9sf3Q9ET30 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Tm9sf3Q9ET30 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Tm9sf3Q9ET30 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Tm9sf3Q9ET30 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Tm9sf3Q9ET30 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13 ms