Protein–RNA interactions for Protein: Q9ERI2

Rab27a, Ras-related protein Rab-27A, mousemouse

Predictions only

Length 221 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab27aQ9ERI2 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,78■■■□□ 2,2
Rab27aQ9ERI2 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC28,76■■■□□ 2,19
Rab27aQ9ERI2 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,76■■■□□ 2,19
Rab27aQ9ERI2 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,75■■■□□ 2,19
Rab27aQ9ERI2 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,74■■■□□ 2,19
Rab27aQ9ERI2 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC28,74■■■□□ 2,19
Rab27aQ9ERI2 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC28,73■■■□□ 2,19
Rab27aQ9ERI2 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC28,73■■■□□ 2,19
Rab27aQ9ERI2 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC28,72■■■□□ 2,19
Rab27aQ9ERI2 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,72■■■□□ 2,19
Rab27aQ9ERI2 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC28,71■■■□□ 2,19
Rab27aQ9ERI2 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,69■■■□□ 2,18
Rab27aQ9ERI2 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC28,68■■■□□ 2,18
Rab27aQ9ERI2 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,66■■■□□ 2,18
Rab27aQ9ERI2 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,65■■■□□ 2,18
Rab27aQ9ERI2 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,65■■■□□ 2,18
Rab27aQ9ERI2 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC28,64■■■□□ 2,18
Rab27aQ9ERI2 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC28,63■■■□□ 2,17
Rab27aQ9ERI2 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28,63■■■□□ 2,17
Rab27aQ9ERI2 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC28,61■■■□□ 2,17
Rab27aQ9ERI2 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC28,6■■■□□ 2,17
Rab27aQ9ERI2 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,59■■■□□ 2,17
Rab27aQ9ERI2 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC28,59■■■□□ 2,17
Rab27aQ9ERI2 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,58■■■□□ 2,17
Rab27aQ9ERI2 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC28,56■■■□□ 2,16
Rab27aQ9ERI2 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC28,53■■■□□ 2,16
Rab27aQ9ERI2 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28,52■■■□□ 2,16
Rab27aQ9ERI2 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28,52■■■□□ 2,16
Rab27aQ9ERI2 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC28,5■■■□□ 2,15
Rab27aQ9ERI2 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,5■■■□□ 2,15
Rab27aQ9ERI2 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC28,49■■■□□ 2,15
Rab27aQ9ERI2 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,49■■■□□ 2,15
Rab27aQ9ERI2 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC28,46■■■□□ 2,15
Rab27aQ9ERI2 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC28,46■■■□□ 2,15
Rab27aQ9ERI2 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC28,46■■■□□ 2,15
Rab27aQ9ERI2 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28,42■■■□□ 2,14
Rab27aQ9ERI2 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,42■■■□□ 2,14
Rab27aQ9ERI2 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,4■■■□□ 2,14
Rab27aQ9ERI2 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC28,39■■■□□ 2,14
Rab27aQ9ERI2 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC28,39■■■□□ 2,14
Rab27aQ9ERI2 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28,35■■■□□ 2,13
Rab27aQ9ERI2 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,32■■■□□ 2,12
Rab27aQ9ERI2 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC28,32■■■□□ 2,12
Rab27aQ9ERI2 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28,28■■■□□ 2,12
Rab27aQ9ERI2 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28,27■■■□□ 2,12
Rab27aQ9ERI2 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,27■■■□□ 2,12
Rab27aQ9ERI2 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,27■■■□□ 2,12
Rab27aQ9ERI2 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC28,27■■■□□ 2,12
Rab27aQ9ERI2 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC28,26■■■□□ 2,12
Rab27aQ9ERI2 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28,24■■■□□ 2,11
Rab27aQ9ERI2 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,24■■■□□ 2,11
Rab27aQ9ERI2 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,24■■■□□ 2,11
Rab27aQ9ERI2 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC28,23■■■□□ 2,11
Rab27aQ9ERI2 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,23■■■□□ 2,11
Rab27aQ9ERI2 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28,23■■■□□ 2,11
Rab27aQ9ERI2 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28,22■■■□□ 2,11
Rab27aQ9ERI2 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC28,22■■■□□ 2,11
Rab27aQ9ERI2 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC28,22■■■□□ 2,11
Rab27aQ9ERI2 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC28,2■■■□□ 2,1
Rab27aQ9ERI2 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC28,19■■■□□ 2,1
Rab27aQ9ERI2 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,18■■■□□ 2,1
Rab27aQ9ERI2 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,16■■■□□ 2,1
Rab27aQ9ERI2 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,16■■■□□ 2,1
Rab27aQ9ERI2 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,16■■■□□ 2,1
Rab27aQ9ERI2 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,15■■■□□ 2,1
Rab27aQ9ERI2 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC28,14■■■□□ 2,1
Rab27aQ9ERI2 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC28,13■■■□□ 2,09
Rab27aQ9ERI2 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,13■■■□□ 2,09
Rab27aQ9ERI2 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,12■■■□□ 2,09
Rab27aQ9ERI2 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC28,12■■■□□ 2,09
Rab27aQ9ERI2 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,12■■■□□ 2,09
Rab27aQ9ERI2 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,12■■■□□ 2,09
Rab27aQ9ERI2 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC28,08■■■□□ 2,09
Rab27aQ9ERI2 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,07■■■□□ 2,08
Rab27aQ9ERI2 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,07■■■□□ 2,08
Rab27aQ9ERI2 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28,06■■■□□ 2,08
Rab27aQ9ERI2 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC28,06■■■□□ 2,08
Rab27aQ9ERI2 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28,05■■■□□ 2,08
Rab27aQ9ERI2 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,04■■■□□ 2,08
Rab27aQ9ERI2 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28,02■■■□□ 2,08
Rab27aQ9ERI2 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,02■■■□□ 2,08
Rab27aQ9ERI2 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28,02■■■□□ 2,08
Rab27aQ9ERI2 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28,01■■■□□ 2,07
Rab27aQ9ERI2 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,01■■■□□ 2,07
Rab27aQ9ERI2 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28■■■□□ 2,07
Rab27aQ9ERI2 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC28■■■□□ 2,07
Rab27aQ9ERI2 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC27,99■■■□□ 2,07
Rab27aQ9ERI2 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC27,97■■■□□ 2,07
Rab27aQ9ERI2 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,97■■■□□ 2,07
Rab27aQ9ERI2 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC27,96■■■□□ 2,07
Rab27aQ9ERI2 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC27,96■■■□□ 2,07
Rab27aQ9ERI2 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27,96■■■□□ 2,07
Rab27aQ9ERI2 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,95■■■□□ 2,07
Rab27aQ9ERI2 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC27,95■■■□□ 2,06
Rab27aQ9ERI2 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27,95■■■□□ 2,06
Rab27aQ9ERI2 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC27,94■■■□□ 2,06
Rab27aQ9ERI2 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,94■■■□□ 2,06
Rab27aQ9ERI2 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27,93■■■□□ 2,06
Rab27aQ9ERI2 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC27,92■■■□□ 2,06
Rab27aQ9ERI2 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,91■■■□□ 2,06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61,4 ms