Protein–RNA interactions for Protein: Q9ER65

Clstn2, Calsyntenin-2, mousemouse

Predictions only

Length 966 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clstn2Q9ER65 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC38.94■■■■□ 3.82
Clstn2Q9ER65 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC38.93■■■■□ 3.82
Clstn2Q9ER65 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.93■■■■□ 3.82
Clstn2Q9ER65 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC38.9■■■■□ 3.82
Clstn2Q9ER65 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.87■■■■□ 3.81
Clstn2Q9ER65 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.86■■■■□ 3.81
Clstn2Q9ER65 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.85■■■■□ 3.81
Clstn2Q9ER65 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC38.84■■■■□ 3.81
Clstn2Q9ER65 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC38.82■■■■□ 3.81
Clstn2Q9ER65 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC38.82■■■■□ 3.8
Clstn2Q9ER65 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC38.81■■■■□ 3.8
Clstn2Q9ER65 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.79■■■■□ 3.8
Clstn2Q9ER65 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC38.78■■■■□ 3.8
Clstn2Q9ER65 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.76■■■■□ 3.8
Clstn2Q9ER65 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC38.74■■■■□ 3.79
Clstn2Q9ER65 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC38.74■■■■□ 3.79
Clstn2Q9ER65 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC38.73■■■■□ 3.79
Clstn2Q9ER65 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC38.71■■■■□ 3.79
Clstn2Q9ER65 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.71■■■■□ 3.79
Clstn2Q9ER65 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.7■■■■□ 3.79
Clstn2Q9ER65 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC38.68■■■■□ 3.78
Clstn2Q9ER65 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.68■■■■□ 3.78
Clstn2Q9ER65 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC38.68■■■■□ 3.78
Clstn2Q9ER65 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC38.65■■■■□ 3.78
Clstn2Q9ER65 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.65■■■■□ 3.78
Clstn2Q9ER65 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC38.64■■■■□ 3.78
Clstn2Q9ER65 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.62■■■■□ 3.77
Clstn2Q9ER65 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.6■■■■□ 3.77
Clstn2Q9ER65 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.59■■■■□ 3.77
Clstn2Q9ER65 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.56■■■■□ 3.76
Clstn2Q9ER65 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC38.52■■■■□ 3.76
Clstn2Q9ER65 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC38.46■■■■□ 3.75
Clstn2Q9ER65 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC38.45■■■■□ 3.75
Clstn2Q9ER65 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.44■■■■□ 3.74
Clstn2Q9ER65 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.43■■■■□ 3.74
Clstn2Q9ER65 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.39■■■■□ 3.74
Clstn2Q9ER65 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC38.38■■■■□ 3.73
Clstn2Q9ER65 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC38.38■■■■□ 3.73
Clstn2Q9ER65 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC38.38■■■■□ 3.73
Clstn2Q9ER65 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.35■■■■□ 3.73
Clstn2Q9ER65 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC38.34■■■■□ 3.73
Clstn2Q9ER65 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.33■■■■□ 3.73
Clstn2Q9ER65 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC38.29■■■■□ 3.72
Clstn2Q9ER65 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.27■■■■□ 3.72
Clstn2Q9ER65 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC38.27■■■■□ 3.72
Clstn2Q9ER65 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC38.25■■■■□ 3.71
Clstn2Q9ER65 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.24■■■■□ 3.71
Clstn2Q9ER65 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.2■■■■□ 3.71
Clstn2Q9ER65 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC38.2■■■■□ 3.71
Clstn2Q9ER65 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.19■■■■□ 3.7
Clstn2Q9ER65 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC38.18■■■■□ 3.7
Clstn2Q9ER65 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.18■■■■□ 3.7
Clstn2Q9ER65 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC38.18■■■■□ 3.7
Clstn2Q9ER65 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC38.17■■■■□ 3.7
Clstn2Q9ER65 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.16■■■■□ 3.7
Clstn2Q9ER65 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.16■■■■□ 3.7
Clstn2Q9ER65 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC38.15■■■■□ 3.7
Clstn2Q9ER65 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC38.15■■■■□ 3.7
Clstn2Q9ER65 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.14■■■■□ 3.7
Clstn2Q9ER65 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC38.13■■■■□ 3.7
Clstn2Q9ER65 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.13■■■■□ 3.69
Clstn2Q9ER65 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.12■■■■□ 3.69
Clstn2Q9ER65 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC38.11■■■■□ 3.69
Clstn2Q9ER65 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.1■■■■□ 3.69
Clstn2Q9ER65 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.1■■■■□ 3.69
Clstn2Q9ER65 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.08■■■■□ 3.69
Clstn2Q9ER65 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC38.06■■■■□ 3.68
Clstn2Q9ER65 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC38.06■■■■□ 3.68
Clstn2Q9ER65 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.05■■■■□ 3.68
Clstn2Q9ER65 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.02■■■■□ 3.68
Clstn2Q9ER65 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC38■■■■□ 3.67
Clstn2Q9ER65 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC38■■■■□ 3.67
Clstn2Q9ER65 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC37.99■■■■□ 3.67
Clstn2Q9ER65 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC37.97■■■■□ 3.67
Clstn2Q9ER65 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC37.97■■■■□ 3.67
Clstn2Q9ER65 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.97■■■■□ 3.67
Clstn2Q9ER65 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.96■■■■□ 3.67
Clstn2Q9ER65 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC37.96■■■■□ 3.67
Clstn2Q9ER65 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.95■■■■□ 3.67
Clstn2Q9ER65 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC37.94■■■■□ 3.66
Clstn2Q9ER65 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.92■■■■□ 3.66
Clstn2Q9ER65 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.92■■■■□ 3.66
Clstn2Q9ER65 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.89■■■■□ 3.66
Clstn2Q9ER65 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC37.89■■■■□ 3.66
Clstn2Q9ER65 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.88■■■■□ 3.66
Clstn2Q9ER65 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC37.85■■■■□ 3.65
Clstn2Q9ER65 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC37.85■■■■□ 3.65
Clstn2Q9ER65 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.84■■■■□ 3.65
Clstn2Q9ER65 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.84■■■■□ 3.65
Clstn2Q9ER65 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC37.83■■■■□ 3.65
Clstn2Q9ER65 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.83■■■■□ 3.65
Clstn2Q9ER65 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC37.83■■■■□ 3.65
Clstn2Q9ER65 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.82■■■■□ 3.65
Clstn2Q9ER65 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC37.82■■■■□ 3.64
Clstn2Q9ER65 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC37.79■■■■□ 3.64
Clstn2Q9ER65 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.78■■■■□ 3.64
Clstn2Q9ER65 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC37.78■■■■□ 3.64
Clstn2Q9ER65 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC37.77■■■■□ 3.64
Clstn2Q9ER65 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.76■■■■□ 3.64
Clstn2Q9ER65 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.76■■■■□ 3.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.8 ms