Protein–RNA interactions for Protein: Q9EPQ2

Rpgrip1, X-linked retinitis pigmentosa GTPase regulator-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpgrip1Q9EPQ2 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC40.53■■■■■ 4.08
Rpgrip1Q9EPQ2 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.52■■■■■ 4.08
Rpgrip1Q9EPQ2 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.51■■■■■ 4.08
Rpgrip1Q9EPQ2 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.5■■■■■ 4.07
Rpgrip1Q9EPQ2 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.49■■■■■ 4.07
Rpgrip1Q9EPQ2 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.47■■■■■ 4.07
Rpgrip1Q9EPQ2 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC40.43■■■■■ 4.06
Rpgrip1Q9EPQ2 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC40.42■■■■■ 4.06
Rpgrip1Q9EPQ2 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC40.41■■■■■ 4.06
Rpgrip1Q9EPQ2 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC40.41■■■■■ 4.06
Rpgrip1Q9EPQ2 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.4■■■■■ 4.06
Rpgrip1Q9EPQ2 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.39■■■■■ 4.06
Rpgrip1Q9EPQ2 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC40.38■■■■■ 4.05
Rpgrip1Q9EPQ2 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.37■■■■■ 4.05
Rpgrip1Q9EPQ2 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC40.36■■■■■ 4.05
Rpgrip1Q9EPQ2 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.34■■■■■ 4.05
Rpgrip1Q9EPQ2 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC40.34■■■■■ 4.05
Rpgrip1Q9EPQ2 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC40.34■■■■■ 4.05
Rpgrip1Q9EPQ2 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.32■■■■■ 4.05
Rpgrip1Q9EPQ2 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.29■■■■■ 4.04
Rpgrip1Q9EPQ2 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC40.28■■■■■ 4.04
Rpgrip1Q9EPQ2 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC40.26■■■■■ 4.04
Rpgrip1Q9EPQ2 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.26■■■■■ 4.04
Rpgrip1Q9EPQ2 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC40.26■■■■■ 4.03
Rpgrip1Q9EPQ2 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC40.23■■■■■ 4.03
Rpgrip1Q9EPQ2 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.22■■■■■ 4.03
Rpgrip1Q9EPQ2 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC40.22■■■■■ 4.03
Rpgrip1Q9EPQ2 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.17■■■■■ 4.02
Rpgrip1Q9EPQ2 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.13■■■■■ 4.01
Rpgrip1Q9EPQ2 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC40.11■■■■■ 4.01
Rpgrip1Q9EPQ2 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.07■■■■■ 4.01
Rpgrip1Q9EPQ2 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC40.07■■■■■ 4
Rpgrip1Q9EPQ2 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC40.07■■■■■ 4
Rpgrip1Q9EPQ2 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC40.03■■■■■ 4
Rpgrip1Q9EPQ2 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC40.02■■■■■ 4
Rpgrip1Q9EPQ2 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.01■■■■□ 3.99
Rpgrip1Q9EPQ2 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.99■■■■□ 3.99
Rpgrip1Q9EPQ2 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.99■■■■□ 3.99
Rpgrip1Q9EPQ2 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.98■■■■□ 3.99
Rpgrip1Q9EPQ2 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC39.97■■■■□ 3.99
Rpgrip1Q9EPQ2 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC39.95■■■■□ 3.99
Rpgrip1Q9EPQ2 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC39.94■■■■□ 3.98
Rpgrip1Q9EPQ2 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC39.94■■■■□ 3.98
Rpgrip1Q9EPQ2 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.93■■■■□ 3.98
Rpgrip1Q9EPQ2 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.93■■■■□ 3.98
Rpgrip1Q9EPQ2 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC39.93■■■■□ 3.98
Rpgrip1Q9EPQ2 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC39.92■■■■□ 3.98
Rpgrip1Q9EPQ2 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC39.91■■■■□ 3.98
Rpgrip1Q9EPQ2 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC39.91■■■■□ 3.98
Rpgrip1Q9EPQ2 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.91■■■■□ 3.98
Rpgrip1Q9EPQ2 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.89■■■■□ 3.98
Rpgrip1Q9EPQ2 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.88■■■■□ 3.97
Rpgrip1Q9EPQ2 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC39.86■■■■□ 3.97
Rpgrip1Q9EPQ2 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC39.85■■■■□ 3.97
Rpgrip1Q9EPQ2 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC39.85■■■■□ 3.97
Rpgrip1Q9EPQ2 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC39.85■■■■□ 3.97
Rpgrip1Q9EPQ2 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.83■■■■□ 3.97
Rpgrip1Q9EPQ2 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC39.82■■■■□ 3.97
Rpgrip1Q9EPQ2 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC39.82■■■■□ 3.97
Rpgrip1Q9EPQ2 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC39.82■■■■□ 3.96
Rpgrip1Q9EPQ2 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC39.81■■■■□ 3.96
Rpgrip1Q9EPQ2 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC39.78■■■■□ 3.96
Rpgrip1Q9EPQ2 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC39.75■■■■□ 3.95
Rpgrip1Q9EPQ2 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC39.75■■■■□ 3.95
Rpgrip1Q9EPQ2 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.74■■■■□ 3.95
Rpgrip1Q9EPQ2 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC39.73■■■■□ 3.95
Rpgrip1Q9EPQ2 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC39.72■■■■□ 3.95
Rpgrip1Q9EPQ2 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC39.72■■■■□ 3.95
Rpgrip1Q9EPQ2 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC39.68■■■■□ 3.94
Rpgrip1Q9EPQ2 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.66■■■■□ 3.94
Rpgrip1Q9EPQ2 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC39.65■■■■□ 3.94
Rpgrip1Q9EPQ2 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.64■■■■□ 3.94
Rpgrip1Q9EPQ2 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.62■■■■□ 3.93
Rpgrip1Q9EPQ2 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC39.62■■■■□ 3.93
Rpgrip1Q9EPQ2 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC39.59■■■■□ 3.93
Rpgrip1Q9EPQ2 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC39.59■■■■□ 3.93
Rpgrip1Q9EPQ2 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC39.58■■■■□ 3.93
Rpgrip1Q9EPQ2 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC39.57■■■■□ 3.92
Rpgrip1Q9EPQ2 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC39.53■■■■□ 3.92
Rpgrip1Q9EPQ2 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.52■■■■□ 3.92
Rpgrip1Q9EPQ2 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.52■■■■□ 3.92
Rpgrip1Q9EPQ2 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC39.52■■■■□ 3.92
Rpgrip1Q9EPQ2 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.51■■■■□ 3.92
Rpgrip1Q9EPQ2 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC39.48■■■■□ 3.91
Rpgrip1Q9EPQ2 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC39.47■■■■□ 3.91
Rpgrip1Q9EPQ2 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC39.46■■■■□ 3.91
Rpgrip1Q9EPQ2 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.46■■■■□ 3.91
Rpgrip1Q9EPQ2 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.45■■■■□ 3.91
Rpgrip1Q9EPQ2 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.45■■■■□ 3.91
Rpgrip1Q9EPQ2 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.44■■■■□ 3.9
Rpgrip1Q9EPQ2 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC39.44■■■■□ 3.9
Rpgrip1Q9EPQ2 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.43■■■■□ 3.9
Rpgrip1Q9EPQ2 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC39.42■■■■□ 3.9
Rpgrip1Q9EPQ2 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.41■■■■□ 3.9
Rpgrip1Q9EPQ2 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC39.39■■■■□ 3.9
Rpgrip1Q9EPQ2 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC39.38■■■■□ 3.9
Rpgrip1Q9EPQ2 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.36■■■■□ 3.89
Rpgrip1Q9EPQ2 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.34■■■■□ 3.89
Rpgrip1Q9EPQ2 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.34■■■■□ 3.89
Rpgrip1Q9EPQ2 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.31■■■■□ 3.88
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.4 ms