Protein–RNA interactions for Protein: Q9DA69

Ift43, Intraflagellar transport protein 43 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 206 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ift43Q9DA69 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Ift43Q9DA69 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
Ift43Q9DA69 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Ift43Q9DA69 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Ift43Q9DA69 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC26.13■■□□□ 1.77
Ift43Q9DA69 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC26.11■■□□□ 1.77
Ift43Q9DA69 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Ift43Q9DA69 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Ift43Q9DA69 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC26.09■■□□□ 1.77
Ift43Q9DA69 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
Ift43Q9DA69 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Ift43Q9DA69 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
Ift43Q9DA69 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
Ift43Q9DA69 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
Ift43Q9DA69 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Ift43Q9DA69 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC26.02■■□□□ 1.76
Ift43Q9DA69 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Ift43Q9DA69 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Ift43Q9DA69 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Ift43Q9DA69 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
Ift43Q9DA69 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Ift43Q9DA69 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Ift43Q9DA69 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
Ift43Q9DA69 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
Ift43Q9DA69 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Ift43Q9DA69 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Ift43Q9DA69 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Ift43Q9DA69 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
Ift43Q9DA69 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
Ift43Q9DA69 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Ift43Q9DA69 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Ift43Q9DA69 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
Ift43Q9DA69 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC25.83■■□□□ 1.73
Ift43Q9DA69 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
Ift43Q9DA69 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Ift43Q9DA69 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Ift43Q9DA69 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Ift43Q9DA69 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Ift43Q9DA69 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Ift43Q9DA69 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Ift43Q9DA69 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Ift43Q9DA69 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Ift43Q9DA69 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Ift43Q9DA69 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Ift43Q9DA69 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Ift43Q9DA69 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
Ift43Q9DA69 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
Ift43Q9DA69 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Ift43Q9DA69 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Ift43Q9DA69 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Ift43Q9DA69 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Ift43Q9DA69 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Ift43Q9DA69 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Ift43Q9DA69 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Ift43Q9DA69 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Ift43Q9DA69 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Ift43Q9DA69 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Ift43Q9DA69 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Ift43Q9DA69 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Ift43Q9DA69 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
Ift43Q9DA69 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
Ift43Q9DA69 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Ift43Q9DA69 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Ift43Q9DA69 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Ift43Q9DA69 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Ift43Q9DA69 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Ift43Q9DA69 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Ift43Q9DA69 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Ift43Q9DA69 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Ift43Q9DA69 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Ift43Q9DA69 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Ift43Q9DA69 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Ift43Q9DA69 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Ift43Q9DA69 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Ift43Q9DA69 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Ift43Q9DA69 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Ift43Q9DA69 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Ift43Q9DA69 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Ift43Q9DA69 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Ift43Q9DA69 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Ift43Q9DA69 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Ift43Q9DA69 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Ift43Q9DA69 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Ift43Q9DA69 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Ift43Q9DA69 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Ift43Q9DA69 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Ift43Q9DA69 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Ift43Q9DA69 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Ift43Q9DA69 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Ift43Q9DA69 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Ift43Q9DA69 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Ift43Q9DA69 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
Ift43Q9DA69 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
Ift43Q9DA69 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Ift43Q9DA69 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Ift43Q9DA69 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Ift43Q9DA69 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Ift43Q9DA69 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Ift43Q9DA69 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Ift43Q9DA69 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.8 ms