Protein–RNA interactions for Protein: Q9D9V4

Rsph9, Radial spoke head protein 9 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 276 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rsph9Q9D9V4 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
Rsph9Q9D9V4 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Rsph9Q9D9V4 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Rsph9Q9D9V4 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Rsph9Q9D9V4 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Rsph9Q9D9V4 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Rsph9Q9D9V4 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Rsph9Q9D9V4 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Rsph9Q9D9V4 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Rsph9Q9D9V4 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Rsph9Q9D9V4 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Rsph9Q9D9V4 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Rsph9Q9D9V4 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Rsph9Q9D9V4 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Rsph9Q9D9V4 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Rsph9Q9D9V4 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Rsph9Q9D9V4 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC25.64■■□□□ 1.7
Rsph9Q9D9V4 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
Rsph9Q9D9V4 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Rsph9Q9D9V4 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Rsph9Q9D9V4 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Rsph9Q9D9V4 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Rsph9Q9D9V4 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Rsph9Q9D9V4 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Rsph9Q9D9V4 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Rsph9Q9D9V4 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Rsph9Q9D9V4 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Rsph9Q9D9V4 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Rsph9Q9D9V4 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Rsph9Q9D9V4 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Rsph9Q9D9V4 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Rsph9Q9D9V4 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Rsph9Q9D9V4 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Rsph9Q9D9V4 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Rsph9Q9D9V4 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Rsph9Q9D9V4 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Rsph9Q9D9V4 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Rsph9Q9D9V4 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Rsph9Q9D9V4 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Rsph9Q9D9V4 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Rsph9Q9D9V4 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
Rsph9Q9D9V4 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Rsph9Q9D9V4 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Rsph9Q9D9V4 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Rsph9Q9D9V4 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Rsph9Q9D9V4 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Rsph9Q9D9V4 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
Rsph9Q9D9V4 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
Rsph9Q9D9V4 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Rsph9Q9D9V4 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Rsph9Q9D9V4 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Rsph9Q9D9V4 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Rsph9Q9D9V4 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Rsph9Q9D9V4 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Rsph9Q9D9V4 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Rsph9Q9D9V4 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Rsph9Q9D9V4 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Rsph9Q9D9V4 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Rsph9Q9D9V4 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
Rsph9Q9D9V4 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Rsph9Q9D9V4 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
Rsph9Q9D9V4 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Rsph9Q9D9V4 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Rsph9Q9D9V4 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Rsph9Q9D9V4 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Rsph9Q9D9V4 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Rsph9Q9D9V4 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Rsph9Q9D9V4 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Rsph9Q9D9V4 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Rsph9Q9D9V4 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Rsph9Q9D9V4 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Rsph9Q9D9V4 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
Rsph9Q9D9V4 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Rsph9Q9D9V4 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Rsph9Q9D9V4 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Rsph9Q9D9V4 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Rsph9Q9D9V4 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
Rsph9Q9D9V4 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Rsph9Q9D9V4 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Rsph9Q9D9V4 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Rsph9Q9D9V4 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Rsph9Q9D9V4 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Rsph9Q9D9V4 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Rsph9Q9D9V4 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
Rsph9Q9D9V4 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Rsph9Q9D9V4 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Rsph9Q9D9V4 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Rsph9Q9D9V4 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Rsph9Q9D9V4 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Rsph9Q9D9V4 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Rsph9Q9D9V4 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Rsph9Q9D9V4 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Rsph9Q9D9V4 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Rsph9Q9D9V4 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Rsph9Q9D9V4 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Rsph9Q9D9V4 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Rsph9Q9D9V4 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Rsph9Q9D9V4 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Rsph9Q9D9V4 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Rsph9Q9D9V4 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.2 ms