Protein–RNA interactions for Protein: Q9D906

Atg7, Ubiquitin-like modifier-activating enzyme ATG7, mousemouse

Predictions only

Length 698 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg7Q9D906 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC28.22■■■□□ 2.11
Atg7Q9D906 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC28.22■■■□□ 2.11
Atg7Q9D906 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
Atg7Q9D906 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Atg7Q9D906 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Atg7Q9D906 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Atg7Q9D906 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC28.16■■■□□ 2.1
Atg7Q9D906 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Atg7Q9D906 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Atg7Q9D906 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Atg7Q9D906 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Atg7Q9D906 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC28.09■■■□□ 2.09
Atg7Q9D906 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC28.09■■■□□ 2.09
Atg7Q9D906 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Atg7Q9D906 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC28.06■■■□□ 2.08
Atg7Q9D906 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Atg7Q9D906 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Atg7Q9D906 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Atg7Q9D906 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Atg7Q9D906 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Atg7Q9D906 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Atg7Q9D906 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
Atg7Q9D906 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Atg7Q9D906 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC27.94■■■□□ 2.06
Atg7Q9D906 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Atg7Q9D906 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC27.92■■■□□ 2.06
Atg7Q9D906 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
Atg7Q9D906 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.91■■■□□ 2.06
Atg7Q9D906 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Atg7Q9D906 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Atg7Q9D906 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Atg7Q9D906 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Atg7Q9D906 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Atg7Q9D906 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Atg7Q9D906 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Atg7Q9D906 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC27.87■■■□□ 2.05
Atg7Q9D906 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Atg7Q9D906 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Atg7Q9D906 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC27.83■■■□□ 2.05
Atg7Q9D906 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
Atg7Q9D906 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC27.79■■■□□ 2.04
Atg7Q9D906 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC27.79■■■□□ 2.04
Atg7Q9D906 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Atg7Q9D906 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC27.75■■■□□ 2.03
Atg7Q9D906 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Atg7Q9D906 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Atg7Q9D906 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Atg7Q9D906 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Atg7Q9D906 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Atg7Q9D906 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Atg7Q9D906 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
Atg7Q9D906 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Atg7Q9D906 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Atg7Q9D906 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Atg7Q9D906 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Atg7Q9D906 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
Atg7Q9D906 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Atg7Q9D906 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Atg7Q9D906 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
Atg7Q9D906 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Atg7Q9D906 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC27.57■■■□□ 2
Atg7Q9D906 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
Atg7Q9D906 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
Atg7Q9D906 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
Atg7Q9D906 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.51■■■□□ 2
Atg7Q9D906 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
Atg7Q9D906 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
Atg7Q9D906 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Atg7Q9D906 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Atg7Q9D906 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Atg7Q9D906 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Atg7Q9D906 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
Atg7Q9D906 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Atg7Q9D906 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Atg7Q9D906 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Atg7Q9D906 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Atg7Q9D906 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
Atg7Q9D906 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Atg7Q9D906 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Atg7Q9D906 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Atg7Q9D906 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Atg7Q9D906 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
Atg7Q9D906 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Atg7Q9D906 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Atg7Q9D906 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC27.39■■□□□ 1.98
Atg7Q9D906 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Atg7Q9D906 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
Atg7Q9D906 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Atg7Q9D906 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Atg7Q9D906 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Atg7Q9D906 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Atg7Q9D906 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
Atg7Q9D906 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
Atg7Q9D906 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
Atg7Q9D906 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Atg7Q9D906 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC27.32■■□□□ 1.96
Atg7Q9D906 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
Atg7Q9D906 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Atg7Q9D906 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
Atg7Q9D906 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.8 ms