Protein–RNA interactions for Protein: Q9D818

Sapcd2, Suppressor APC domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 391 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sapcd2Q9D818 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30,51■■■□□ 2,47
Sapcd2Q9D818 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC30,5■■■□□ 2,47
Sapcd2Q9D818 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC30,49■■■□□ 2,47
Sapcd2Q9D818 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,47■■■□□ 2,47
Sapcd2Q9D818 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,46■■■□□ 2,47
Sapcd2Q9D818 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30,45■■■□□ 2,46
Sapcd2Q9D818 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC30,44■■■□□ 2,46
Sapcd2Q9D818 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC30,42■■■□□ 2,46
Sapcd2Q9D818 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,42■■■□□ 2,46
Sapcd2Q9D818 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC30,4■■■□□ 2,46
Sapcd2Q9D818 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC30,39■■■□□ 2,46
Sapcd2Q9D818 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,39■■■□□ 2,46
Sapcd2Q9D818 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,37■■■□□ 2,45
Sapcd2Q9D818 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30,36■■■□□ 2,45
Sapcd2Q9D818 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,36■■■□□ 2,45
Sapcd2Q9D818 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30,35■■■□□ 2,45
Sapcd2Q9D818 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC30,35■■■□□ 2,45
Sapcd2Q9D818 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC30,33■■■□□ 2,45
Sapcd2Q9D818 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC30,33■■■□□ 2,45
Sapcd2Q9D818 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,33■■■□□ 2,45
Sapcd2Q9D818 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,32■■■□□ 2,44
Sapcd2Q9D818 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,32■■■□□ 2,44
Sapcd2Q9D818 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC30,31■■■□□ 2,44
Sapcd2Q9D818 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,31■■■□□ 2,44
Sapcd2Q9D818 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,3■■■□□ 2,44
Sapcd2Q9D818 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,28■■■□□ 2,44
Sapcd2Q9D818 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,27■■■□□ 2,44
Sapcd2Q9D818 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,26■■■□□ 2,44
Sapcd2Q9D818 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC30,26■■■□□ 2,43
Sapcd2Q9D818 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC30,26■■■□□ 2,43
Sapcd2Q9D818 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC30,26■■■□□ 2,43
Sapcd2Q9D818 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC30,22■■■□□ 2,43
Sapcd2Q9D818 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30,19■■■□□ 2,42
Sapcd2Q9D818 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30,13■■■□□ 2,41
Sapcd2Q9D818 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30,12■■■□□ 2,41
Sapcd2Q9D818 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC30,11■■■□□ 2,41
Sapcd2Q9D818 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,1■■■□□ 2,41
Sapcd2Q9D818 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,08■■■□□ 2,41
Sapcd2Q9D818 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC30,06■■■□□ 2,4
Sapcd2Q9D818 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC30,06■■■□□ 2,4
Sapcd2Q9D818 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,04■■■□□ 2,4
Sapcd2Q9D818 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC30,04■■■□□ 2,4
Sapcd2Q9D818 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC30,03■■■□□ 2,4
Sapcd2Q9D818 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC30,03■■■□□ 2,4
Sapcd2Q9D818 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,02■■■□□ 2,4
Sapcd2Q9D818 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC29,99■■■□□ 2,39
Sapcd2Q9D818 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,97■■■□□ 2,39
Sapcd2Q9D818 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,96■■■□□ 2,39
Sapcd2Q9D818 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29,95■■■□□ 2,38
Sapcd2Q9D818 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,93■■■□□ 2,38
Sapcd2Q9D818 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29,93■■■□□ 2,38
Sapcd2Q9D818 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29,92■■■□□ 2,38
Sapcd2Q9D818 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,92■■■□□ 2,38
Sapcd2Q9D818 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29,92■■■□□ 2,38
Sapcd2Q9D818 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC29,92■■■□□ 2,38
Sapcd2Q9D818 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC29,9■■■□□ 2,38
Sapcd2Q9D818 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC29,9■■■□□ 2,38
Sapcd2Q9D818 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC29,88■■■□□ 2,37
Sapcd2Q9D818 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29,87■■■□□ 2,37
Sapcd2Q9D818 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC29,86■■■□□ 2,37
Sapcd2Q9D818 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,85■■■□□ 2,37
Sapcd2Q9D818 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,85■■■□□ 2,37
Sapcd2Q9D818 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC29,82■■■□□ 2,36
Sapcd2Q9D818 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,82■■■□□ 2,36
Sapcd2Q9D818 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC29,81■■■□□ 2,36
Sapcd2Q9D818 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC29,8■■■□□ 2,36
Sapcd2Q9D818 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29,8■■■□□ 2,36
Sapcd2Q9D818 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC29,79■■■□□ 2,36
Sapcd2Q9D818 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,79■■■□□ 2,36
Sapcd2Q9D818 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,78■■■□□ 2,36
Sapcd2Q9D818 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC29,77■■■□□ 2,36
Sapcd2Q9D818 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC29,77■■■□□ 2,36
Sapcd2Q9D818 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29,76■■■□□ 2,35
Sapcd2Q9D818 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC29,75■■■□□ 2,35
Sapcd2Q9D818 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC29,74■■■□□ 2,35
Sapcd2Q9D818 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,73■■■□□ 2,35
Sapcd2Q9D818 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC29,72■■■□□ 2,35
Sapcd2Q9D818 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29,71■■■□□ 2,35
Sapcd2Q9D818 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29,71■■■□□ 2,35
Sapcd2Q9D818 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29,71■■■□□ 2,35
Sapcd2Q9D818 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,71■■■□□ 2,35
Sapcd2Q9D818 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,7■■■□□ 2,34
Sapcd2Q9D818 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,69■■■□□ 2,34
Sapcd2Q9D818 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC29,69■■■□□ 2,34
Sapcd2Q9D818 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,68■■■□□ 2,34
Sapcd2Q9D818 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,67■■■□□ 2,34
Sapcd2Q9D818 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,66■■■□□ 2,34
Sapcd2Q9D818 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29,66■■■□□ 2,34
Sapcd2Q9D818 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29,66■■■□□ 2,34
Sapcd2Q9D818 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29,65■■■□□ 2,34
Sapcd2Q9D818 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,64■■■□□ 2,34
Sapcd2Q9D818 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC29,64■■■□□ 2,34
Sapcd2Q9D818 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,64■■■□□ 2,34
Sapcd2Q9D818 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC29,63■■■□□ 2,33
Sapcd2Q9D818 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,63■■■□□ 2,33
Sapcd2Q9D818 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC29,62■■■□□ 2,33
Sapcd2Q9D818 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29,62■■■□□ 2,33
Sapcd2Q9D818 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,6■■■□□ 2,33
Sapcd2Q9D818 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC29,59■■■□□ 2,33
Sapcd2Q9D818 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC29,57■■■□□ 2,32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20,9 ms