Protein–RNA interactions for Protein: Q9D727

Uncharacterized protein C6orf226 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 114 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9D727 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Q9D727 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Q9D727 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
Q9D727 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Q9D727 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Q9D727 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Q9D727 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Q9D727 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Q9D727 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Q9D727 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Q9D727 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Q9D727 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Q9D727 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Q9D727 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Q9D727 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Q9D727 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Q9D727 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Q9D727 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Q9D727 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Q9D727 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Q9D727 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Q9D727 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Q9D727 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Q9D727 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Q9D727 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Q9D727 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Q9D727 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Q9D727 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Q9D727 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Q9D727 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Q9D727 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Q9D727 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Q9D727 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Q9D727 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Q9D727 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Q9D727 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Q9D727 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Q9D727 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Q9D727 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Q9D727 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Q9D727 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Q9D727 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Q9D727 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Q9D727 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Q9D727 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Q9D727 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Q9D727 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Q9D727 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Q9D727 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Q9D727 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Q9D727 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Q9D727 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Q9D727 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Q9D727 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Q9D727 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Q9D727 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Q9D727 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Q9D727 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Q9D727 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Q9D727 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Q9D727 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Q9D727 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Q9D727 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Q9D727 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Q9D727 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Q9D727 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Q9D727 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Q9D727 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Q9D727 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Q9D727 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Q9D727 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Q9D727 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Q9D727 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Q9D727 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Q9D727 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Q9D727 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Q9D727 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Q9D727 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Q9D727 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Q9D727 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Q9D727 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Q9D727 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Q9D727 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Q9D727 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Q9D727 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Q9D727 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Q9D727 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Q9D727 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Q9D727 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Q9D727 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Q9D727 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Q9D727 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Q9D727 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Q9D727 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Q9D727 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Q9D727 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Q9D727 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Q9D727 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Q9D727 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Q9D727 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 8.2 ms