Protein–RNA interactions for Protein: Q9D701

Upk3bl1, Uroplakin-3b-like protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 249 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Upk3bl1Q9D701 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Upk3bl1Q9D701 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Upk3bl1Q9D701 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Upk3bl1Q9D701 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Upk3bl1Q9D701 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Upk3bl1Q9D701 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Upk3bl1Q9D701 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Upk3bl1Q9D701 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
Upk3bl1Q9D701 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Upk3bl1Q9D701 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Upk3bl1Q9D701 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Upk3bl1Q9D701 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Upk3bl1Q9D701 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Upk3bl1Q9D701 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Upk3bl1Q9D701 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Upk3bl1Q9D701 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Upk3bl1Q9D701 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Upk3bl1Q9D701 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Upk3bl1Q9D701 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Upk3bl1Q9D701 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Upk3bl1Q9D701 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Upk3bl1Q9D701 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Upk3bl1Q9D701 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Upk3bl1Q9D701 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Upk3bl1Q9D701 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Upk3bl1Q9D701 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Upk3bl1Q9D701 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Upk3bl1Q9D701 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Upk3bl1Q9D701 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Upk3bl1Q9D701 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Upk3bl1Q9D701 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
Upk3bl1Q9D701 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Upk3bl1Q9D701 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Upk3bl1Q9D701 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Upk3bl1Q9D701 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Upk3bl1Q9D701 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Upk3bl1Q9D701 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Upk3bl1Q9D701 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Upk3bl1Q9D701 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Upk3bl1Q9D701 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Upk3bl1Q9D701 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Upk3bl1Q9D701 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Upk3bl1Q9D701 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Upk3bl1Q9D701 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Upk3bl1Q9D701 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Upk3bl1Q9D701 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Upk3bl1Q9D701 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Upk3bl1Q9D701 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Upk3bl1Q9D701 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Upk3bl1Q9D701 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Upk3bl1Q9D701 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Upk3bl1Q9D701 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Upk3bl1Q9D701 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Upk3bl1Q9D701 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Upk3bl1Q9D701 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Upk3bl1Q9D701 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Upk3bl1Q9D701 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Upk3bl1Q9D701 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Upk3bl1Q9D701 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Upk3bl1Q9D701 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Upk3bl1Q9D701 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Upk3bl1Q9D701 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Upk3bl1Q9D701 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Upk3bl1Q9D701 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Upk3bl1Q9D701 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Upk3bl1Q9D701 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Upk3bl1Q9D701 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
Upk3bl1Q9D701 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Upk3bl1Q9D701 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Upk3bl1Q9D701 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Upk3bl1Q9D701 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Upk3bl1Q9D701 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Upk3bl1Q9D701 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Upk3bl1Q9D701 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Upk3bl1Q9D701 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Upk3bl1Q9D701 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Upk3bl1Q9D701 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Upk3bl1Q9D701 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Upk3bl1Q9D701 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Upk3bl1Q9D701 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Upk3bl1Q9D701 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Upk3bl1Q9D701 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Upk3bl1Q9D701 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Upk3bl1Q9D701 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Upk3bl1Q9D701 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Upk3bl1Q9D701 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Upk3bl1Q9D701 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Upk3bl1Q9D701 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Upk3bl1Q9D701 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Upk3bl1Q9D701 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Upk3bl1Q9D701 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Upk3bl1Q9D701 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Upk3bl1Q9D701 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Upk3bl1Q9D701 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Upk3bl1Q9D701 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Upk3bl1Q9D701 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Upk3bl1Q9D701 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Upk3bl1Q9D701 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Upk3bl1Q9D701 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
Upk3bl1Q9D701 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 8.6 ms