Protein–RNA interactions for Protein: Q9D3F6

Ms4a4c, MCG12897, mousemouse

Predictions only

Length 226 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ms4a4cQ9D3F6 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Ms4a4cQ9D3F6 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Ms4a4cQ9D3F6 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Ms4a4cQ9D3F6 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Ms4a4cQ9D3F6 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
Ms4a4cQ9D3F6 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Ms4a4cQ9D3F6 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Ms4a4cQ9D3F6 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Ms4a4cQ9D3F6 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Ms4a4cQ9D3F6 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Ms4a4cQ9D3F6 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Ms4a4cQ9D3F6 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Ms4a4cQ9D3F6 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Ms4a4cQ9D3F6 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC20.7■□□□□ 0.9
Ms4a4cQ9D3F6 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Ms4a4cQ9D3F6 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
Ms4a4cQ9D3F6 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Ms4a4cQ9D3F6 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC20.68■□□□□ 0.9
Ms4a4cQ9D3F6 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Ms4a4cQ9D3F6 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Ms4a4cQ9D3F6 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Ms4a4cQ9D3F6 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
Ms4a4cQ9D3F6 Prorsd1-201ENSMUST00000039900 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Ms4a4cQ9D3F6 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Ms4a4cQ9D3F6 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Ms4a4cQ9D3F6 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Ms4a4cQ9D3F6 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Ms4a4cQ9D3F6 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Ms4a4cQ9D3F6 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Ms4a4cQ9D3F6 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Ms4a4cQ9D3F6 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Ms4a4cQ9D3F6 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
Ms4a4cQ9D3F6 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Ms4a4cQ9D3F6 5830487J09Rik-201ENSMUST00000198600 1256 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ms4a4cQ9D3F6 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
Ms4a4cQ9D3F6 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Ms4a4cQ9D3F6 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Ms4a4cQ9D3F6 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ms4a4cQ9D3F6 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ms4a4cQ9D3F6 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ms4a4cQ9D3F6 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ms4a4cQ9D3F6 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ms4a4cQ9D3F6 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ms4a4cQ9D3F6 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ms4a4cQ9D3F6 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ms4a4cQ9D3F6 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ms4a4cQ9D3F6 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ms4a4cQ9D3F6 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ms4a4cQ9D3F6 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ms4a4cQ9D3F6 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ms4a4cQ9D3F6 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ms4a4cQ9D3F6 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ms4a4cQ9D3F6 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ms4a4cQ9D3F6 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ms4a4cQ9D3F6 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ms4a4cQ9D3F6 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ms4a4cQ9D3F6 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
Ms4a4cQ9D3F6 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ms4a4cQ9D3F6 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ms4a4cQ9D3F6 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ms4a4cQ9D3F6 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ms4a4cQ9D3F6 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ms4a4cQ9D3F6 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ms4a4cQ9D3F6 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
Ms4a4cQ9D3F6 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Ms4a4cQ9D3F6 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Ms4a4cQ9D3F6 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Ms4a4cQ9D3F6 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Ms4a4cQ9D3F6 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ms4a4cQ9D3F6 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ms4a4cQ9D3F6 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ms4a4cQ9D3F6 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ms4a4cQ9D3F6 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ms4a4cQ9D3F6 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ms4a4cQ9D3F6 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ms4a4cQ9D3F6 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ms4a4cQ9D3F6 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ms4a4cQ9D3F6 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ms4a4cQ9D3F6 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ms4a4cQ9D3F6 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ms4a4cQ9D3F6 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ms4a4cQ9D3F6 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ms4a4cQ9D3F6 Gm37444-201ENSMUST00000193605 439 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
Ms4a4cQ9D3F6 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ms4a4cQ9D3F6 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ms4a4cQ9D3F6 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ms4a4cQ9D3F6 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Ms4a4cQ9D3F6 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ms4a4cQ9D3F6 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ms4a4cQ9D3F6 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ms4a4cQ9D3F6 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ms4a4cQ9D3F6 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ms4a4cQ9D3F6 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ms4a4cQ9D3F6 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ms4a4cQ9D3F6 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ms4a4cQ9D3F6 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ms4a4cQ9D3F6 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ms4a4cQ9D3F6 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ms4a4cQ9D3F6 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Ms4a4cQ9D3F6 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 8.2 ms