Protein–RNA interactions for Protein: Q9D1N2

Gpihbp1, Glycosylphosphatidylinositol-anchored high density lipoprotein-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 228 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gpihbp1Q9D1N2 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25,9■■□□□ 1,74
Gpihbp1Q9D1N2 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25,89■■□□□ 1,74
Gpihbp1Q9D1N2 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,89■■□□□ 1,73
Gpihbp1Q9D1N2 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC25,88■■□□□ 1,73
Gpihbp1Q9D1N2 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,87■■□□□ 1,73
Gpihbp1Q9D1N2 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,86■■□□□ 1,73
Gpihbp1Q9D1N2 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25,85■■□□□ 1,73
Gpihbp1Q9D1N2 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25,85■■□□□ 1,73
Gpihbp1Q9D1N2 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,82■■□□□ 1,72
Gpihbp1Q9D1N2 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,81■■□□□ 1,72
Gpihbp1Q9D1N2 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25,81■■□□□ 1,72
Gpihbp1Q9D1N2 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25,8■■□□□ 1,72
Gpihbp1Q9D1N2 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC25,79■■□□□ 1,72
Gpihbp1Q9D1N2 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC25,78■■□□□ 1,72
Gpihbp1Q9D1N2 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC25,78■■□□□ 1,72
Gpihbp1Q9D1N2 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC25,78■■□□□ 1,72
Gpihbp1Q9D1N2 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,77■■□□□ 1,72
Gpihbp1Q9D1N2 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,75■■□□□ 1,71
Gpihbp1Q9D1N2 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,75■■□□□ 1,71
Gpihbp1Q9D1N2 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,74■■□□□ 1,71
Gpihbp1Q9D1N2 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC25,73■■□□□ 1,71
Gpihbp1Q9D1N2 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC25,73■■□□□ 1,71
Gpihbp1Q9D1N2 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC25,73■■□□□ 1,71
Gpihbp1Q9D1N2 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,73■■□□□ 1,71
Gpihbp1Q9D1N2 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25,71■■□□□ 1,71
Gpihbp1Q9D1N2 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC25,71■■□□□ 1,71
Gpihbp1Q9D1N2 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,68■■□□□ 1,7
Gpihbp1Q9D1N2 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,67■■□□□ 1,7
Gpihbp1Q9D1N2 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,66■■□□□ 1,7
Gpihbp1Q9D1N2 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,66■■□□□ 1,7
Gpihbp1Q9D1N2 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,66■■□□□ 1,7
Gpihbp1Q9D1N2 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25,65■■□□□ 1,7
Gpihbp1Q9D1N2 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,65■■□□□ 1,7
Gpihbp1Q9D1N2 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC25,64■■□□□ 1,7
Gpihbp1Q9D1N2 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,64■■□□□ 1,69
Gpihbp1Q9D1N2 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC25,62■■□□□ 1,69
Gpihbp1Q9D1N2 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25,62■■□□□ 1,69
Gpihbp1Q9D1N2 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC25,61■■□□□ 1,69
Gpihbp1Q9D1N2 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25,61■■□□□ 1,69
Gpihbp1Q9D1N2 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25,6■■□□□ 1,69
Gpihbp1Q9D1N2 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,6■■□□□ 1,69
Gpihbp1Q9D1N2 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC25,58■■□□□ 1,69
Gpihbp1Q9D1N2 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,57■■□□□ 1,68
Gpihbp1Q9D1N2 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25,57■■□□□ 1,68
Gpihbp1Q9D1N2 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,57■■□□□ 1,68
Gpihbp1Q9D1N2 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC25,56■■□□□ 1,68
Gpihbp1Q9D1N2 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25,56■■□□□ 1,68
Gpihbp1Q9D1N2 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC25,54■■□□□ 1,68
Gpihbp1Q9D1N2 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC25,53■■□□□ 1,68
Gpihbp1Q9D1N2 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25,53■■□□□ 1,68
Gpihbp1Q9D1N2 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25,53■■□□□ 1,68
Gpihbp1Q9D1N2 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC25,53■■□□□ 1,68
Gpihbp1Q9D1N2 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,53■■□□□ 1,68
Gpihbp1Q9D1N2 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25,52■■□□□ 1,68
Gpihbp1Q9D1N2 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC25,49■■□□□ 1,67
Gpihbp1Q9D1N2 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25,48■■□□□ 1,67
Gpihbp1Q9D1N2 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC25,47■■□□□ 1,67
Gpihbp1Q9D1N2 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25,45■■□□□ 1,66
Gpihbp1Q9D1N2 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC25,42■■□□□ 1,66
Gpihbp1Q9D1N2 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC25,41■■□□□ 1,66
Gpihbp1Q9D1N2 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,41■■□□□ 1,66
Gpihbp1Q9D1N2 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,41■■□□□ 1,66
Gpihbp1Q9D1N2 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25,39■■□□□ 1,66
Gpihbp1Q9D1N2 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC25,39■■□□□ 1,65
Gpihbp1Q9D1N2 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,37■■□□□ 1,65
Gpihbp1Q9D1N2 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25,36■■□□□ 1,65
Gpihbp1Q9D1N2 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25,35■■□□□ 1,65
Gpihbp1Q9D1N2 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25,34■■□□□ 1,65
Gpihbp1Q9D1N2 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC25,31■■□□□ 1,64
Gpihbp1Q9D1N2 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,31■■□□□ 1,64
Gpihbp1Q9D1N2 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25,3■■□□□ 1,64
Gpihbp1Q9D1N2 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25,29■■□□□ 1,64
Gpihbp1Q9D1N2 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25,29■■□□□ 1,64
Gpihbp1Q9D1N2 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,29■■□□□ 1,64
Gpihbp1Q9D1N2 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC25,28■■□□□ 1,64
Gpihbp1Q9D1N2 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,27■■□□□ 1,64
Gpihbp1Q9D1N2 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC25,26■■□□□ 1,63
Gpihbp1Q9D1N2 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25,26■■□□□ 1,63
Gpihbp1Q9D1N2 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC25,25■■□□□ 1,63
Gpihbp1Q9D1N2 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC25,25■■□□□ 1,63
Gpihbp1Q9D1N2 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25,24■■□□□ 1,63
Gpihbp1Q9D1N2 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,23■■□□□ 1,63
Gpihbp1Q9D1N2 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,22■■□□□ 1,63
Gpihbp1Q9D1N2 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC25,22■■□□□ 1,63
Gpihbp1Q9D1N2 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC25,18■■□□□ 1,62
Gpihbp1Q9D1N2 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC25,18■■□□□ 1,62
Gpihbp1Q9D1N2 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,17■■□□□ 1,62
Gpihbp1Q9D1N2 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC25,16■■□□□ 1,62
Gpihbp1Q9D1N2 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC25,16■■□□□ 1,62
Gpihbp1Q9D1N2 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC25,15■■□□□ 1,62
Gpihbp1Q9D1N2 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC25,15■■□□□ 1,62
Gpihbp1Q9D1N2 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25,15■■□□□ 1,62
Gpihbp1Q9D1N2 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC25,15■■□□□ 1,62
Gpihbp1Q9D1N2 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC25,13■■□□□ 1,61
Gpihbp1Q9D1N2 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,12■■□□□ 1,61
Gpihbp1Q9D1N2 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC25,12■■□□□ 1,61
Gpihbp1Q9D1N2 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25,1■■□□□ 1,61
Gpihbp1Q9D1N2 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25,1■■□□□ 1,61
Gpihbp1Q9D1N2 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC25,09■■□□□ 1,61
Gpihbp1Q9D1N2 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC25,09■■□□□ 1,61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10,8 ms