Protein–RNA interactions for Protein: Q9D176

Susd3, Sushi domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 269 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Susd3Q9D176 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC28,25■■■□□ 2,11
Susd3Q9D176 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC28,25■■■□□ 2,11
Susd3Q9D176 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC28,24■■■□□ 2,11
Susd3Q9D176 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC28,23■■■□□ 2,11
Susd3Q9D176 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC28,22■■■□□ 2,11
Susd3Q9D176 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC28,19■■■□□ 2,1
Susd3Q9D176 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC28,16■■■□□ 2,1
Susd3Q9D176 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,16■■■□□ 2,1
Susd3Q9D176 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,15■■■□□ 2,1
Susd3Q9D176 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,11■■■□□ 2,09
Susd3Q9D176 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC28,11■■■□□ 2,09
Susd3Q9D176 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28,11■■■□□ 2,09
Susd3Q9D176 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,09■■■□□ 2,09
Susd3Q9D176 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,09■■■□□ 2,09
Susd3Q9D176 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28,08■■■□□ 2,09
Susd3Q9D176 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28,07■■■□□ 2,08
Susd3Q9D176 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC28,04■■■□□ 2,08
Susd3Q9D176 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,03■■■□□ 2,08
Susd3Q9D176 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2,07
Susd3Q9D176 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,99■■■□□ 2,07
Susd3Q9D176 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC27,99■■■□□ 2,07
Susd3Q9D176 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC27,98■■■□□ 2,07
Susd3Q9D176 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC27,97■■■□□ 2,07
Susd3Q9D176 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC27,96■■■□□ 2,07
Susd3Q9D176 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC27,96■■■□□ 2,07
Susd3Q9D176 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC27,94■■■□□ 2,06
Susd3Q9D176 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC27,93■■■□□ 2,06
Susd3Q9D176 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,92■■■□□ 2,06
Susd3Q9D176 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,91■■■□□ 2,06
Susd3Q9D176 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC27,89■■■□□ 2,06
Susd3Q9D176 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC27,89■■■□□ 2,05
Susd3Q9D176 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC27,88■■■□□ 2,05
Susd3Q9D176 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC27,87■■■□□ 2,05
Susd3Q9D176 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,85■■■□□ 2,05
Susd3Q9D176 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC27,85■■■□□ 2,05
Susd3Q9D176 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,85■■■□□ 2,05
Susd3Q9D176 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,82■■■□□ 2,04
Susd3Q9D176 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,8■■■□□ 2,04
Susd3Q9D176 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC27,78■■■□□ 2,04
Susd3Q9D176 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC27,77■■■□□ 2,04
Susd3Q9D176 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC27,77■■■□□ 2,04
Susd3Q9D176 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,77■■■□□ 2,04
Susd3Q9D176 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC27,75■■■□□ 2,03
Susd3Q9D176 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC27,73■■■□□ 2,03
Susd3Q9D176 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27,69■■■□□ 2,02
Susd3Q9D176 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC27,69■■■□□ 2,02
Susd3Q9D176 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27,68■■■□□ 2,02
Susd3Q9D176 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC27,67■■■□□ 2,02
Susd3Q9D176 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC27,67■■■□□ 2,02
Susd3Q9D176 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,66■■■□□ 2,02
Susd3Q9D176 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,65■■■□□ 2,02
Susd3Q9D176 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC27,64■■■□□ 2,02
Susd3Q9D176 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC27,64■■■□□ 2,01
Susd3Q9D176 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC27,62■■■□□ 2,01
Susd3Q9D176 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27,62■■■□□ 2,01
Susd3Q9D176 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC27,61■■■□□ 2,01
Susd3Q9D176 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,6■■■□□ 2,01
Susd3Q9D176 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,58■■■□□ 2,01
Susd3Q9D176 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,56■■■□□ 2
Susd3Q9D176 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,52■■■□□ 2
Susd3Q9D176 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,49■■□□□ 1,99
Susd3Q9D176 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC27,48■■□□□ 1,99
Susd3Q9D176 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC27,47■■□□□ 1,99
Susd3Q9D176 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,45■■□□□ 1,98
Susd3Q9D176 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC27,44■■□□□ 1,98
Susd3Q9D176 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,43■■□□□ 1,98
Susd3Q9D176 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,41■■□□□ 1,98
Susd3Q9D176 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC27,4■■□□□ 1,98
Susd3Q9D176 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC27,38■■□□□ 1,97
Susd3Q9D176 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC27,36■■□□□ 1,97
Susd3Q9D176 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC27,36■■□□□ 1,97
Susd3Q9D176 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,32■■□□□ 1,96
Susd3Q9D176 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,29■■□□□ 1,96
Susd3Q9D176 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27,27■■□□□ 1,96
Susd3Q9D176 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC27,27■■□□□ 1,96
Susd3Q9D176 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC27,23■■□□□ 1,95
Susd3Q9D176 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC27,21■■□□□ 1,95
Susd3Q9D176 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27,21■■□□□ 1,95
Susd3Q9D176 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC27,21■■□□□ 1,95
Susd3Q9D176 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27,21■■□□□ 1,95
Susd3Q9D176 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27,18■■□□□ 1,94
Susd3Q9D176 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,17■■□□□ 1,94
Susd3Q9D176 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC27,17■■□□□ 1,94
Susd3Q9D176 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC27,16■■□□□ 1,94
Susd3Q9D176 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC27,15■■□□□ 1,94
Susd3Q9D176 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC27,15■■□□□ 1,94
Susd3Q9D176 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27,14■■□□□ 1,94
Susd3Q9D176 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC27,14■■□□□ 1,93
Susd3Q9D176 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC27,1■■□□□ 1,93
Susd3Q9D176 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27,09■■□□□ 1,93
Susd3Q9D176 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,08■■□□□ 1,93
Susd3Q9D176 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC27,08■■□□□ 1,93
Susd3Q9D176 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27,07■■□□□ 1,92
Susd3Q9D176 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC27,07■■□□□ 1,92
Susd3Q9D176 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC27,07■■□□□ 1,92
Susd3Q9D176 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC27,07■■□□□ 1,92
Susd3Q9D176 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC27,07■■□□□ 1,92
Susd3Q9D176 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27,06■■□□□ 1,92
Susd3Q9D176 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC27,06■■□□□ 1,92
Susd3Q9D176 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC27,06■■□□□ 1,92
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11,3 ms