Protein–RNA interactions for Protein: Q9CYS6

Uncharacterized protein C2orf72 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 286 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9CYS6 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Q9CYS6 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
Q9CYS6 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Q9CYS6 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Q9CYS6 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Q9CYS6 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Q9CYS6 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Q9CYS6 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Q9CYS6 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Q9CYS6 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Q9CYS6 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Q9CYS6 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Q9CYS6 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
Q9CYS6 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Q9CYS6 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Q9CYS6 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Q9CYS6 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Q9CYS6 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Q9CYS6 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Q9CYS6 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Q9CYS6 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Q9CYS6 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Q9CYS6 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Q9CYS6 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
Q9CYS6 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Q9CYS6 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Q9CYS6 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Q9CYS6 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Q9CYS6 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Q9CYS6 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Q9CYS6 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Q9CYS6 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Q9CYS6 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Q9CYS6 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
Q9CYS6 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
Q9CYS6 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Q9CYS6 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Q9CYS6 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Q9CYS6 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Q9CYS6 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Q9CYS6 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Q9CYS6 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Q9CYS6 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Q9CYS6 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Q9CYS6 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Q9CYS6 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
Q9CYS6 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Q9CYS6 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Q9CYS6 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Q9CYS6 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Q9CYS6 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Q9CYS6 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Q9CYS6 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Q9CYS6 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Q9CYS6 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Q9CYS6 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Q9CYS6 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Q9CYS6 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Q9CYS6 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Q9CYS6 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Q9CYS6 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
Q9CYS6 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
Q9CYS6 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Q9CYS6 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Q9CYS6 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Q9CYS6 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Q9CYS6 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Q9CYS6 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Q9CYS6 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Q9CYS6 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Q9CYS6 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Q9CYS6 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Q9CYS6 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Q9CYS6 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Q9CYS6 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Q9CYS6 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Q9CYS6 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Q9CYS6 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Q9CYS6 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
Q9CYS6 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Q9CYS6 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Q9CYS6 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Q9CYS6 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Q9CYS6 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Q9CYS6 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Q9CYS6 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Q9CYS6 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Q9CYS6 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Q9CYS6 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Q9CYS6 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
Q9CYS6 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Q9CYS6 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Q9CYS6 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Q9CYS6 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Q9CYS6 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Q9CYS6 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Q9CYS6 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Q9CYS6 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Q9CYS6 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Q9CYS6 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.9 ms