Protein–RNA interactions for Protein: Q9CX30

Yif1b, Protein YIF1B, mousemouse

Predictions only

Length 311 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Yif1bQ9CX30 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Yif1bQ9CX30 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Yif1bQ9CX30 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Yif1bQ9CX30 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Yif1bQ9CX30 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Yif1bQ9CX30 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
Yif1bQ9CX30 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Yif1bQ9CX30 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Yif1bQ9CX30 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Yif1bQ9CX30 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Yif1bQ9CX30 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Yif1bQ9CX30 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Yif1bQ9CX30 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Yif1bQ9CX30 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Yif1bQ9CX30 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Yif1bQ9CX30 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
Yif1bQ9CX30 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Yif1bQ9CX30 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Yif1bQ9CX30 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
Yif1bQ9CX30 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Yif1bQ9CX30 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Yif1bQ9CX30 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Yif1bQ9CX30 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Yif1bQ9CX30 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Yif1bQ9CX30 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Yif1bQ9CX30 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Yif1bQ9CX30 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Yif1bQ9CX30 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Yif1bQ9CX30 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Yif1bQ9CX30 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
Yif1bQ9CX30 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Yif1bQ9CX30 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Yif1bQ9CX30 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
Yif1bQ9CX30 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Yif1bQ9CX30 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Yif1bQ9CX30 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Yif1bQ9CX30 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Yif1bQ9CX30 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Yif1bQ9CX30 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
Yif1bQ9CX30 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Yif1bQ9CX30 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Yif1bQ9CX30 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Yif1bQ9CX30 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Yif1bQ9CX30 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Yif1bQ9CX30 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Yif1bQ9CX30 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Yif1bQ9CX30 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Yif1bQ9CX30 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Yif1bQ9CX30 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Yif1bQ9CX30 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Yif1bQ9CX30 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Yif1bQ9CX30 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Yif1bQ9CX30 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Yif1bQ9CX30 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Yif1bQ9CX30 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Yif1bQ9CX30 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
Yif1bQ9CX30 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Yif1bQ9CX30 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Yif1bQ9CX30 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Yif1bQ9CX30 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Yif1bQ9CX30 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Yif1bQ9CX30 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Yif1bQ9CX30 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Yif1bQ9CX30 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Yif1bQ9CX30 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Yif1bQ9CX30 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Yif1bQ9CX30 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Yif1bQ9CX30 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Yif1bQ9CX30 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
Yif1bQ9CX30 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Yif1bQ9CX30 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
Yif1bQ9CX30 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Yif1bQ9CX30 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Yif1bQ9CX30 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Yif1bQ9CX30 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Yif1bQ9CX30 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Yif1bQ9CX30 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Yif1bQ9CX30 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Yif1bQ9CX30 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Yif1bQ9CX30 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Yif1bQ9CX30 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Yif1bQ9CX30 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Yif1bQ9CX30 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Yif1bQ9CX30 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Yif1bQ9CX30 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Yif1bQ9CX30 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Yif1bQ9CX30 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Yif1bQ9CX30 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Yif1bQ9CX30 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Yif1bQ9CX30 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
Yif1bQ9CX30 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Yif1bQ9CX30 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Yif1bQ9CX30 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Yif1bQ9CX30 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Yif1bQ9CX30 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Yif1bQ9CX30 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Yif1bQ9CX30 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Yif1bQ9CX30 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
Yif1bQ9CX30 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Yif1bQ9CX30 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.8 ms