Protein–RNA interactions for Protein: Q9CRB9

Chchd3, MICOS complex subunit Mic19, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 227 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chchd3Q9CRB9 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Chchd3Q9CRB9 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Chchd3Q9CRB9 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Chchd3Q9CRB9 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Chchd3Q9CRB9 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Chchd3Q9CRB9 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Chchd3Q9CRB9 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Chchd3Q9CRB9 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Chchd3Q9CRB9 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Chchd3Q9CRB9 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
Chchd3Q9CRB9 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Chchd3Q9CRB9 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Chchd3Q9CRB9 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Chchd3Q9CRB9 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Chchd3Q9CRB9 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Chchd3Q9CRB9 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Chchd3Q9CRB9 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Chchd3Q9CRB9 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Chchd3Q9CRB9 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Chchd3Q9CRB9 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Chchd3Q9CRB9 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Chchd3Q9CRB9 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Chchd3Q9CRB9 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Chchd3Q9CRB9 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Chchd3Q9CRB9 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Chchd3Q9CRB9 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
Chchd3Q9CRB9 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Chchd3Q9CRB9 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Chchd3Q9CRB9 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Chchd3Q9CRB9 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Chchd3Q9CRB9 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Chchd3Q9CRB9 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Chchd3Q9CRB9 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Chchd3Q9CRB9 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Chchd3Q9CRB9 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Chchd3Q9CRB9 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Chchd3Q9CRB9 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Chchd3Q9CRB9 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Chchd3Q9CRB9 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Chchd3Q9CRB9 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Chchd3Q9CRB9 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Chchd3Q9CRB9 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Chchd3Q9CRB9 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
Chchd3Q9CRB9 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
Chchd3Q9CRB9 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Chchd3Q9CRB9 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
Chchd3Q9CRB9 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
Chchd3Q9CRB9 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Chchd3Q9CRB9 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Chchd3Q9CRB9 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Chchd3Q9CRB9 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Chchd3Q9CRB9 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Chchd3Q9CRB9 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Chchd3Q9CRB9 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Chchd3Q9CRB9 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Chchd3Q9CRB9 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Chchd3Q9CRB9 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
Chchd3Q9CRB9 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Chchd3Q9CRB9 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Chchd3Q9CRB9 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Chchd3Q9CRB9 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
Chchd3Q9CRB9 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Chchd3Q9CRB9 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
Chchd3Q9CRB9 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
Chchd3Q9CRB9 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
Chchd3Q9CRB9 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Chchd3Q9CRB9 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Chchd3Q9CRB9 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Chchd3Q9CRB9 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Chchd3Q9CRB9 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Chchd3Q9CRB9 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Chchd3Q9CRB9 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Chchd3Q9CRB9 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Chchd3Q9CRB9 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Chchd3Q9CRB9 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Chchd3Q9CRB9 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Chchd3Q9CRB9 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Chchd3Q9CRB9 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Chchd3Q9CRB9 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Chchd3Q9CRB9 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Chchd3Q9CRB9 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Chchd3Q9CRB9 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Chchd3Q9CRB9 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Chchd3Q9CRB9 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Chchd3Q9CRB9 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Chchd3Q9CRB9 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Chchd3Q9CRB9 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Chchd3Q9CRB9 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Chchd3Q9CRB9 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Chchd3Q9CRB9 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Chchd3Q9CRB9 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Chchd3Q9CRB9 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Chchd3Q9CRB9 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Chchd3Q9CRB9 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Chchd3Q9CRB9 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Chchd3Q9CRB9 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Chchd3Q9CRB9 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Chchd3Q9CRB9 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Chchd3Q9CRB9 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Chchd3Q9CRB9 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 7.7 ms