Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQY8

Tm4sf20, Transmembrane 4 L6 family member 20, mousemouse

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Length 226 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tm4sf20Q9CQY8 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Tm4sf20Q9CQY8 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Tm4sf20Q9CQY8 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
Tm4sf20Q9CQY8 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Tm4sf20Q9CQY8 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Tm4sf20Q9CQY8 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Tm4sf20Q9CQY8 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Tm4sf20Q9CQY8 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Tm4sf20Q9CQY8 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Tm4sf20Q9CQY8 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Tm4sf20Q9CQY8 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Tm4sf20Q9CQY8 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Tm4sf20Q9CQY8 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Tm4sf20Q9CQY8 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Tm4sf20Q9CQY8 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Tm4sf20Q9CQY8 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Tm4sf20Q9CQY8 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Tm4sf20Q9CQY8 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Tm4sf20Q9CQY8 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Tm4sf20Q9CQY8 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Tm4sf20Q9CQY8 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Tm4sf20Q9CQY8 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Tm4sf20Q9CQY8 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Tm4sf20Q9CQY8 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Tm4sf20Q9CQY8 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Tm4sf20Q9CQY8 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Tm4sf20Q9CQY8 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Tm4sf20Q9CQY8 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Tm4sf20Q9CQY8 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Tm4sf20Q9CQY8 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Tm4sf20Q9CQY8 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Tm4sf20Q9CQY8 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Tm4sf20Q9CQY8 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tm4sf20Q9CQY8 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Tm4sf20Q9CQY8 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tm4sf20Q9CQY8 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tm4sf20Q9CQY8 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Tm4sf20Q9CQY8 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tm4sf20Q9CQY8 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tm4sf20Q9CQY8 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tm4sf20Q9CQY8 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tm4sf20Q9CQY8 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tm4sf20Q9CQY8 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Tm4sf20Q9CQY8 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Tm4sf20Q9CQY8 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Tm4sf20Q9CQY8 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Tm4sf20Q9CQY8 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Tm4sf20Q9CQY8 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Tm4sf20Q9CQY8 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Tm4sf20Q9CQY8 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Tm4sf20Q9CQY8 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Tm4sf20Q9CQY8 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Tm4sf20Q9CQY8 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Tm4sf20Q9CQY8 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Tm4sf20Q9CQY8 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Tm4sf20Q9CQY8 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Tm4sf20Q9CQY8 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Tm4sf20Q9CQY8 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Tm4sf20Q9CQY8 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Tm4sf20Q9CQY8 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Tm4sf20Q9CQY8 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Tm4sf20Q9CQY8 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Tm4sf20Q9CQY8 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Tm4sf20Q9CQY8 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Tm4sf20Q9CQY8 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Tm4sf20Q9CQY8 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Tm4sf20Q9CQY8 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Tm4sf20Q9CQY8 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Tm4sf20Q9CQY8 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Tm4sf20Q9CQY8 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Tm4sf20Q9CQY8 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Tm4sf20Q9CQY8 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Tm4sf20Q9CQY8 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Tm4sf20Q9CQY8 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Tm4sf20Q9CQY8 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Tm4sf20Q9CQY8 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Tm4sf20Q9CQY8 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Tm4sf20Q9CQY8 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Tm4sf20Q9CQY8 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Tm4sf20Q9CQY8 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Tm4sf20Q9CQY8 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tm4sf20Q9CQY8 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tm4sf20Q9CQY8 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tm4sf20Q9CQY8 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tm4sf20Q9CQY8 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tm4sf20Q9CQY8 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tm4sf20Q9CQY8 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tm4sf20Q9CQY8 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tm4sf20Q9CQY8 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tm4sf20Q9CQY8 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tm4sf20Q9CQY8 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tm4sf20Q9CQY8 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tm4sf20Q9CQY8 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tm4sf20Q9CQY8 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tm4sf20Q9CQY8 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Tm4sf20Q9CQY8 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Tm4sf20Q9CQY8 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Tm4sf20Q9CQY8 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Tm4sf20Q9CQY8 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tm4sf20Q9CQY8 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
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