Protein–RNA interactions for Protein: Q9CPP6

Ndufa5, NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 alpha subcomplex subunit 5, mousemouse

Predictions only

Length 116 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ndufa5Q9CPP6 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ndufa5Q9CPP6 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ndufa5Q9CPP6 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ndufa5Q9CPP6 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ndufa5Q9CPP6 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ndufa5Q9CPP6 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ndufa5Q9CPP6 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ndufa5Q9CPP6 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ndufa5Q9CPP6 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ndufa5Q9CPP6 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
Ndufa5Q9CPP6 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Ndufa5Q9CPP6 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ndufa5Q9CPP6 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ndufa5Q9CPP6 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ndufa5Q9CPP6 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ndufa5Q9CPP6 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ndufa5Q9CPP6 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ndufa5Q9CPP6 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ndufa5Q9CPP6 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ndufa5Q9CPP6 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ndufa5Q9CPP6 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ndufa5Q9CPP6 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ndufa5Q9CPP6 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ndufa5Q9CPP6 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Ndufa5Q9CPP6 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ndufa5Q9CPP6 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
Ndufa5Q9CPP6 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ndufa5Q9CPP6 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ndufa5Q9CPP6 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ndufa5Q9CPP6 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ndufa5Q9CPP6 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ndufa5Q9CPP6 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ndufa5Q9CPP6 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ndufa5Q9CPP6 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ndufa5Q9CPP6 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ndufa5Q9CPP6 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Ndufa5Q9CPP6 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Ndufa5Q9CPP6 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ndufa5Q9CPP6 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ndufa5Q9CPP6 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ndufa5Q9CPP6 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ndufa5Q9CPP6 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ndufa5Q9CPP6 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ndufa5Q9CPP6 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ndufa5Q9CPP6 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ndufa5Q9CPP6 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ndufa5Q9CPP6 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Ndufa5Q9CPP6 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ndufa5Q9CPP6 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ndufa5Q9CPP6 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ndufa5Q9CPP6 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ndufa5Q9CPP6 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ndufa5Q9CPP6 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ndufa5Q9CPP6 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ndufa5Q9CPP6 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ndufa5Q9CPP6 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ndufa5Q9CPP6 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ndufa5Q9CPP6 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ndufa5Q9CPP6 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ndufa5Q9CPP6 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ndufa5Q9CPP6 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ndufa5Q9CPP6 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ndufa5Q9CPP6 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ndufa5Q9CPP6 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ndufa5Q9CPP6 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
Ndufa5Q9CPP6 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ndufa5Q9CPP6 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ndufa5Q9CPP6 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ndufa5Q9CPP6 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
Ndufa5Q9CPP6 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Ndufa5Q9CPP6 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ndufa5Q9CPP6 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ndufa5Q9CPP6 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ndufa5Q9CPP6 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
Ndufa5Q9CPP6 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ndufa5Q9CPP6 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ndufa5Q9CPP6 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ndufa5Q9CPP6 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ndufa5Q9CPP6 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ndufa5Q9CPP6 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ndufa5Q9CPP6 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ndufa5Q9CPP6 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC21.77■■□□□ 1.07
Ndufa5Q9CPP6 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ndufa5Q9CPP6 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ndufa5Q9CPP6 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ndufa5Q9CPP6 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ndufa5Q9CPP6 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ndufa5Q9CPP6 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ndufa5Q9CPP6 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ndufa5Q9CPP6 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ndufa5Q9CPP6 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ndufa5Q9CPP6 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ndufa5Q9CPP6 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ndufa5Q9CPP6 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ndufa5Q9CPP6 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC21.7■■□□□ 1.07
Ndufa5Q9CPP6 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ndufa5Q9CPP6 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ndufa5Q9CPP6 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ndufa5Q9CPP6 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ndufa5Q9CPP6 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.5 ms